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全データベースリスト

AIST/HQL人体寸法・形状データベース2003

主な対象データ
形態特性データ
運用機関
産業技術総合研究所 人工知能研究センター
生物種
ヒト
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AISTダンスビデオデータベース

主な対象データ
動画
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
ヒト
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AIST人体寸法データベース 1991-92

主な対象データ
人体のデータ
運用機関
産業技術総合研究所 人工知能研究センター
生物種
ヒト
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AIST人体寸法データベース 1997-98

主な対象データ
人体のデータ
運用機関
産業技術総合研究所 人工知能研究センター
生物種
ヒト
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AIST歩行データベース2019

主な対象データ
歩行データ
運用機関
産業技術総合研究所 人工知能研究センター
生物種
ヒト
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AIST顔表情データベース

主な対象データ
顔情報
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
ヒト
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AJCSD

主な対象データ
化学物質
運用機関
製品評価技術基盤機構 化学物質管理センター
生物種
なし
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Arch GeNet

主な対象データ
遺伝子発現
運用機関
産業技術総合研究所 脳神経情報研究部門
生物種
Thermoplasma volcanium GSS1 [Taxonomy_id: 273116, サーモプラズマ・ボルカニウム]
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ARCHAIC

主な対象データ
DNA-配列 、ゲノム
運用機関
産業技術総合研究所 脳神経情報研究部門
生物種
Archaeoglobus fulgidus [Taxonomy_id: 2234, アーケオグロブス・フルギダス] | Pyrococcus horikoshii OT3 [Taxonomy_id: 70601, パイロコッカス・ホリコシイ] | Thermoplasma volcanium GSS1 [Taxonomy_id: 273116, サーモプラズマ・ボルカニウム]
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ARMLiPDB

主な対象データ
遺伝子発現
運用機関
産業技術総合研究所 年齢軸生命工学研究センター
生物種
Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス]
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ARTRA

主な対象データ
遺伝子発現 マイクロアレイ
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
植物-シロイヌナズナ
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ASTRA

主な対象データ
DNA-配列
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
Arabidopsis thaliana | Caenorhabditis elegans | Drosophila melanogaster | Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ] | Caenorhabditis elegans [Taxonomy_id: 6239, 線虫] | Drosophila melanogaster [Taxonomy_id: 7227, キイロショウジョウバエ] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Oryza sativa [Taxonomy_id: 4530, イネ]
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ATTED II

主な対象データ
遺伝子発現 、マイクロアレイ、パスウェイ
運用機関
東北大学 | 東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター
生物種
Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ]
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CellMontage

主な対象データ
遺伝子発現 | 細胞 | 組織
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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CELLPEDIA

主な対象データ
細胞
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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CGH Data Base

主な対象データ
病気-ガン
運用機関
東京医科歯科大学 難治疾患研究所
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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ConfC

主な対象データ
タンパク質-立体構造
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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CoP

主な対象データ
遺伝子発現
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
Arabidopsis thaliana | Glycine max | Hordeum vulgare | Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ] | Glycine max [Taxonomy_id: 3847, ダイズ] | Hordeum vulgare [Taxonomy_id: 4513, オオムギ] | Oryza sativa [Taxonomy_id: 4530, イネ] | Populus trichocarpa [Taxonomy_id: 3694, コットンウッド] | Triticum aestivum [Taxonomy_id: 4565, コムギ] | Vitis vinifera [Taxonomy_id: 29760, ブドウ] | Zea mays [Taxonomy_id: 4577, トウモロコシ]
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COVID-19症例データベース

主な対象データ
COVID19の症例
運用機関
自治医科大学
生物種
ヒト
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DAGViz

主な対象データ
アノテーション GO
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
Agrobacterium tumefaciens str. C58 | Anaplasma phagocytophilum HZ | Arabidopsis thaliana | Agrobacterium tumefaciens str. C58 [Taxonomy_id: 176299, アグロバクテリウム・ツメファシエンス] | Anaplasma phagocytophilum HZ [Taxonomy_id: 212042, アナプラズマ・ファゴサイトフィルム] | Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ] | Bacillus anthracis str. Ames [Taxonomy_id: 198094, 炭疽菌] | Bos taurus [Taxonomy_id: 9913, ウシ] | Caenorhabditis elegans [Taxonomy_id: 6239, 線虫] | Campylobacter jejuni RM1221 [Taxonomy_id: 195099, カンピロバクター・ジェジュニ] | Candida albicans [Taxonomy_id: 5476, カンジダ・アルビカンス] | Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 [Taxonomy_id: 246194, カーボキシドサーマス・ハイドロゲノフォルマンス] | Clostridium perfringens ATCC 13124 [Taxonomy_id: 195103, ウェルシュ菌] | Colwellia psychrerythraea 34H [Taxonomy_id: 167879, コルウェリア・サイクレリスラエ] | Coxiella burnetii RSA 493 [Taxonomy_id: 227377, Q熱コクシエラ] | Danio rerio [Taxonomy_id: 7955, ゼブラフィッシュ] | Dehalococcoides ethenogenes 195 [Taxonomy_id: 243164] | Dictyostelium discoideum [Taxonomy_id: 44689, キイロタマホコリカビ] | Drosophila melanogaster [Taxonomy_id: 7227, キイロショウジョウバエ] | Ehrlichia chaffeensis Arkansas [Taxonomy_id: 205920, エーリキア・シャフェンシス] | Escherichia coli [Taxonomy_id: 562, 大腸菌] | Gallus gallus [Taxonomy_id: 9031, ニワトリ] | Geobacter sulfurreducens PCA [Taxonomy_id: 243231, ゲオバクター・スルフレデュセンス] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Hyphomonas neptunium ATCC 15444 [Taxonomy_id: 228405, ハイフォモナス・ネプチュニウム] | Leishmania major [Taxonomy_id: 5664, 森林型熱帯リーシュマニア] | Listeria monocytogenes serotype 4b str. F2365 [Taxonomy_id: 265669, リステリア菌] | Magnaporthe grisea [Taxonomy_id: 148305, イネいもち病菌] | Methylococcus capsulatus str. Bath [Taxonomy_id: 243233, メチロコッカス・カプスラタス] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Neorickettsia sennetsu str. Miyayama [Taxonomy_id: 222891, ネオリケッチア・センネツ] | Oomycetes [Taxonomy_id: 4762, 卵菌] | Oryza sativa [Taxonomy_id: 4530, イネ] | Plasmodium falciparum [Taxonomy_id: 5833, 熱帯熱マラリア原虫] | Pseudomonas aeruginosa PAO1 [Taxonomy_id: 208964, 緑膿菌] | Pseudomonas fluorescens Pf-5 [Taxonomy_id: 220664, 蛍光菌] | Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A [Taxonomy_id: 264730, シリンゲ菌] | Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 [Taxonomy_id: 223283, シリンゲ菌] | Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット] | Saccharomyces cerevisiae [Taxonomy_id: 4932, 出芽酵母] | Schizosaccharomyces pombe [Taxonomy_id: 4896, 分裂酵母] | Shewanella oneidensis MR-1 [Taxonomy_id: 211586, シェワネラ・オネイデンシス] | Silicibacter pomeroyi DSS-3 [Taxonomy_id: 246200, サイリシバクター・ポメロイ] | Solanaceae [Taxonomy_id: 4070, ナス科] | Trypanosoma brucei [Taxonomy_id: 5691, ブルセイトリパノソーマ] | Vibrio cholerae [Taxonomy_id: 666, コレラ菌]
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Data and Biological Resource Platform(生物資源データプラットフォーム)

主な対象データ
生物資源に関する情報(微生物株情報、分離源など)、データ(ゲノム、実験データ、画像など)
運用機関
製品評価技術基盤機構
生物種
微生物
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DB-SPIRE

主な対象データ
タンパク質-モチーフ
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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DIAM

主な対象データ
文献 、バイオセイフティ情報
運用機関
バイオインダストリー協会
生物種
微生物全般
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Distribution of Human cDNA Clones

主な対象データ
DNA-配列
運用機関
製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター
生物種
ヒト
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DNA ProbeLocator

主な対象データ
遺伝子発現 プローブ
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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DoBISCUIT

主な対象データ
アノテーション 、二次代謝産物
運用機関
製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター
生物種
Pseudomonas fluorescens | Sorangium cellulosum | Stigmatella aurantiaca | Actinosporangium vitaminophilum ATCC 31673 [Taxonomy_id: 76728] | Amycolatopsis mediterranei S699 [Taxonomy_id: 33910] | Micromonospora megalomicea subsp. nigra NRRL 3275 [Taxonomy_id: 136926] | Mycobacterium ulcerans Agy99 [Taxonomy_id: 362242, マイコバクテリウム・ウルセランス] | Nostoc sp. ATCC 53789 [Taxonomy_id: 76335] | Pseudomonas fluorescens Pf-5 [Taxonomy_id: 220664, 蛍光菌] | Saccharopolyspora spinosa NRRL 18538 [Taxonomy_id: 60894] | Sorangium cellulosum So ce26 [Taxonomy_id: 56, 粘液細菌] | Sorangium cellulosum So ce90 [Taxonomy_id: 56, 粘液細菌] | Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 [Taxonomy_id: 378806, スチグマテラ・オーランチアカ] | Stigmatella aurantiaca Sga15 [Taxonomy_id: 41, スチグマテラ・オーランチアカ] | Streptomyces achromogenes var. rubradiris NRRL3061 [Taxonomy_id: 285531] | Streptomyces antibioticus ATCC 11891 [Taxonomy_id: 1890, ストレプトマイセス・アンチビオチクス] | Streptomyces antibioticus DSM 40725 [Taxonomy_id: 1890, ストレプトマイセス・アンチビオチクス] | Streptomyces antibioticus NRRL 8167 [Taxonomy_id: 1890, ストレプトマイセス・アンチビオチクス] | Streptomyces aureofaciens T?117 [Taxonomy_id: 1894, ストレプトマイセス・オーレオファシエンス] | Streptomyces avermitilis ATCC 31267 [Taxonomy_id: 33903] | Streptomyces bikiniensis NRRL 2737 [Taxonomy_id: 1896] | Streptomyces caelestis NRRL 2821 [Taxonomy_id: 36816] | Streptomyces cinnamonensis ATCC 15413 [Taxonomy_id: 1900] | Streptomyces coelicolor A3 [Taxonomy_id: 100226, ストレプトマイセス・セリカラー] | Streptomyces collinus T?365 [Taxonomy_id: 42684] | Streptomyces cyanogenus S136 [Taxonomy_id: 80860] | Streptomyces diastaticus 108 [Taxonomy_id: 1956] | Streptomyces fradiae T?2717 [Taxonomy_id: 1906] | Streptomyces griseoflavus G? 3592 [Taxonomy_id: 35619] | Streptomyces griseoruber ATCC 15422 [Taxonomy_id: 1943] | Streptomyces griseus K-63 [Taxonomy_id: 1911, ストレプトマイセス・グリセウス] | Streptomyces halstedii HC34 [Taxonomy_id: 1944] | Streptomyces hygroscopicus AM 3672 [Taxonomy_id: 1912] | Streptomyces hygroscopicus NRRL 5491 [Taxonomy_id: 1912] | Streptomyces hygroscopicus subsp. ascomyceticus ATCC 14891 [Taxonomy_id: 132248] | Streptomyces lasaliensis ATCC 31180 [Taxonomy_id: 324833] | Streptomyces lydicus NRRL 2433 [Taxonomy_id: 47763] | Streptomyces nanchangensis NS3226 [Taxonomy_id: 204925] | Streptomyces natalensis ATCC 27448 [Taxonomy_id: 68242] | Streptomyces neyagawaensis ATCC 27749 [Taxonomy_id: 42238] | Streptomyces nodosus ATCC 14899 [Taxonomy_id: 40318] | Streptomyces noursei ATCC 11455 [Taxonomy_id: 316284, ストレプトマイセス・ノウルセイ] | Streptomyces parvulus T?4055 [Taxonomy_id: 146923] | Streptomyces platensis Mer-11107 [Taxonomy_id: 58346] | Streptomyces roseofulvus AK24158 [Taxonomy_id: 33902] | Streptomyces sp. AM-7161 [Taxonomy_id: 221710] | Streptomyces sp. CK4412 [Taxonomy_id: 404220] | Streptomyces sp. CM020 [Taxonomy_id: 569580] | Streptomyces sp. FR-008 [Taxonomy_id: 206662] | Streptomyces sp. HK803 [Taxonomy_id: 244967] | Streptomyces sp. NRRL 11266 [Taxonomy_id: 299254] | Streptomyces sp. R1128 [Taxonomy_id: 140437] | Streptomyces sp. SCC-2136 [Taxonomy_id: 264024] | Streptomyces spiroverticillatus [Taxonomy_id: 673666] | Streptomyces thioluteus HKI-227 [Taxonomy_id: 66431] | Streptomyces venezuelae ATCC 15439 [Taxonomy_id: 54571] | Streptomyces venezuelae ISP5230 [Taxonomy_id: 54571] | Streptomyces violaceoruber T?22 [Taxonomy_id: 1935] | Streptomyces violaceusniger [Taxonomy_id: 68280, ストレプトマイセス・バイオラセウスニガー] | Streptomyces violaceusniger DSM 4137 [Taxonomy_id: 68280] | Streptomyces virginiae MAFF11-0615 [Taxonomy_id: 1961]
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DOGAN

主な対象データ
DNA-配列 、プロテオーム
運用機関
製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター
生物種
Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 | Acidiphilium multivorum AIU301 | Aeropyrum pernix K1 | Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 [Taxonomy_id: 634457] | Acidiphilium multivorum AIU301 [Taxonomy_id: 926570] | Aeropyrum pernix K1 [Taxonomy_id: 272557, アエロパイラム・ペルニクス] | Anaerolinea thermophila UNI-1 [Taxonomy_id: 926569] | Arthrospira platensis NIES-39 [Taxonomy_id: 696747] | Aspergillus oryzae RIB40 [Taxonomy_id: 510516, コウジカビ] | Brevibacillus brevis NBRC 100599 [Taxonomy_id: 358681] | Caldisericum exile AZM16c01 [Taxonomy_id: 511051] | Corynebacterium efficiens YS-314 [Taxonomy_id: 196164] | Deferribacter desulfuricans SSM1 [Taxonomy_id: 639282] | Desulfovibrio magneticus RS-1 [Taxonomy_id: 573370] | Gemmatimonas aurantiaca T-27 [Taxonomy_id: 379066] | Kitasatospora setae [Taxonomy_id: 2066] | Kocuria rhizophila DC2201 [Taxonomy_id: 378753] | Methanocella paludicola SANAE [Taxonomy_id: 304371] | Microlunatus phosphovorus NM-1 [Taxonomy_id: 1032480] | Oscillibacter valericigenes Sjm18-20 [Taxonomy_id: 693746] | Pyrococcus horikoshii OT3 [Taxonomy_id: 70601, パイロコッカス・ホリコシイ] | Rhodococcus erythropolis PR4 [Taxonomy_id: 234621] | Rhodococcus opacus B4 [Taxonomy_id: 632772] | Saccharomyces cerevisiae Kyokai no. 7 [Taxonomy_id: 721032, 出芽酵母] | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240 [Taxonomy_id: 718274, サルモネラ菌] | Sphingobium japonicum UT26S [Taxonomy_id: 452662] | Sphingobium sp. SYK-6 [Taxonomy_id: 627192] | Staphylococcus aureus subsp. aureus MW2 [Taxonomy_id: 196620, 黄色ブドウ球菌] | Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 [Taxonomy_id: 158879, 黄色ブドウ球菌] | Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 [Taxonomy_id: 279808, スタフィロコッカス・ヘモリチカス] | Streptomyces avermitilis MA-4680 [Taxonomy_id: 227882] | Sulfolobus tokodaii str. 7 [Taxonomy_id: 273063] | Tetragenococcus halophilus NBRC 12172 [Taxonomy_id: 945021]
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Evola

主な対象データ
比較ゲノム
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens | Pan troglodytes | Pongo abelii | Bos taurus [Taxonomy_id: 9913, ウシ] | Canis familiaris [Taxonomy_id: 9615, イヌ] | Danio rerio [Taxonomy_id: 7955, ゼブラフィッシュ] | Equus caballus [Taxonomy_id: 9796, ウマ] | Gallus gallus [Taxonomy_id: 9031, ニワトリ] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Macaca mulatta [Taxonomy_id: 9544, アカゲザル] | Monodelphis domestica [Taxonomy_id: 13616, ハイイロジネズミオポッサム] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Oryzias latipes [Taxonomy_id: 8090, メダカ] | Pan troglodytes [Taxonomy_id: 9598, チンパンジー] | Pongo abelii [Taxonomy_id: 9601, スマトラオランウータン] | Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット] | Takifugu rubripes [Taxonomy_id: 31033, トラフグ] | Tetraodon nigroviridis [Taxonomy_id: 99883]
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EzCatDB

主な対象データ
タンパク質-立体構造 酵素
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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FLJ Human cDNA Database

主な対象データ
DNA-配列 完全長cDNA
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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FuLoJa

主な対象データ
DNA-モチーフ
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
Lotus japonicus [Taxonomy_id: 34305, ミヤコグサ]
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G-compass

主な対象データ
比較ゲノム
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens | Bos taurus | Canis lupus familiaris | Bos taurus [Taxonomy_id: 9913, ウシ] | Canis lupus familiaris [Taxonomy_id: 9615, ハイイロオオカミ] | Danio rerio [Taxonomy_id: 7955, ゼブラフィッシュ] | Equus caballus [Taxonomy_id: 9796, ウマ] | Gallus gallus [Taxonomy_id: 9031, ニワトリ] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Macaca mulatta [Taxonomy_id: 9544, アカゲザル] | Monodelphis domestica [Taxonomy_id: 13616, ハイイロジネズミオポッサム] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Oryzias latipes [Taxonomy_id: 8090, メダカ] | Pan troglodytes [Taxonomy_id: 9598, チンパンジー] | Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット] | Tetraodon nigroviridis [Taxonomy_id: 99883]
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GENIUS II

主な対象データ
タンパク質-配列 アミノ酸配列
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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GenoBase

主な対象データ
アノテーション
運用機関
奈良先端科学技術大学院大学 | パデュー大学
生物種
Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 [Taxonomy_id: 511145, 大腸菌] | Escherichia coli str. K-12 substr. W3110 [Taxonomy_id: 316407, 大腸菌]
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GGDB

主な対象データ
DNA-配列 | 基質 | 発現
運用機関
産業技術総合研究所 糖鎖医工学研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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GlycoExplorer

主な対象データ
糖鎖
運用機関
産業技術総合研究所 糖鎖医工学研究センター
生物種
全生物種
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Glycoforum

主な対象データ
ドキュメント | 論文
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
なし
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GlycoPatDB

主な対象データ
糖鎖
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
なし
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GlycoPOD

主な対象データ
糖鎖科学実験プロトコール
運用機関
産業技術総合研究所 糖鎖医工学研究センター
生物種
全生物種
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GlycoProtDB

主な対象データ
タンパク質-モチーフ
運用機関
産業技術総合研究所 糖鎖医工学研究センター
生物種
Caenorhabditis elegans [Taxonomy_id: 6239, 線虫] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス]
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GMDB

主な対象データ
糖鎖
運用機関
産業技術総合研究所 糖鎖医工学研究センター
生物種
全生物種
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H-ANGEL

主な対象データ
遺伝子発現
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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H-DBAS

主な対象データ
ヒト・マウス完全長cDNA、ヒト・マウスmRNA、ラット・チンパンジー・アカゲザル・イヌRNA
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Canis lupus familiaris [Taxonomy_id: 9615, ハイイロオオカミ] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Macaca mulatta [Taxonomy_id: 9544, アカゲザル] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Pan troglodytes [Taxonomy_id: 9598, チンパンジー] | Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット]
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H-EPD

主な対象データ
タンパク質-配列
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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H-Exp

主な対象データ
遺伝子発現
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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H-InvDB

主な対象データ
RNA ヒト完全長cDNA, mRNA
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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HGPD

主な対象データ
DNA-配列
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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INOH Pathway Database

主な対象データ
タンパク質-プロテオーム
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター | 東京大学大学院 新領域創成科学研究科
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット]
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JSNP DATABASE

主な対象データ
DNA-多型 アレル(対立遺伝子)頻度
運用機関
東京大学 | 科学技術振興機構
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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KATANA

主な対象データ
遺伝子発現 、代謝経路、GO
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ]
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KNApSAcK

主な対象データ
代謝産物 マススペクトル
運用機関
奈良先端科学技術大学院大学
生物種
植物全般
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KNApSAck Family

主な対象データ
代謝産物
運用機関
奈良先端科学技術大学院大学
生物種
植物、微生物、ヒト
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KomicMarket

主な対象データ
代謝産物 、マススペクトル
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
Solanum lycopersicum | Arabidopsis thaliana | Brassica oleracea var. capitata | Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ] | Brassica oleracea var. capitata [Taxonomy_id: 3716, ブラッシカ・オレラセア] | Chlamydomonas reinhardtii [Taxonomy_id: 3055, コナミドリムシ] | Dicksonia antarctica [Taxonomy_id: 3271] | Grifola frondosa [Taxonomy_id: 5627, マイタケ] | Jatropha curcas [Taxonomy_id: 180498] | Lotus japonicus [Taxonomy_id: 34305, ミヤコグサ] | Physcomitrella patens subsp. patens [Taxonomy_id: 145481, ニセツリガネゴケ] | Solanum lycopersicum [Taxonomy_id: 4081, トマト] | Synechocystis sp. PCC 6803 [Taxonomy_id: 1148]
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LEGENDA

主な対象データ
文献 、遺伝子、疾患、基質
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
全生物種
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LfDB

主な対象データ
糖鎖  レクチン
運用機関
産業技術総合研究所 糖鎖医工学研究センター
生物種
Abrus precatorius | Agaricus bisporus | Agrocybe cylindracea | Abrus precatorius [Taxonomy_id: 3816] | Agaricus bisporus [Taxonomy_id: 5341] | Agrocybe cylindracea [Taxonomy_id: 64608, ヤナギマツタケ] | Aleuria aurantia [Taxonomy_id: 5188, ヒイロチャワンタケ] | Allium sativum [Taxonomy_id: 4682, ニンニク] | Amaranthus caudatus [Taxonomy_id: 3567, センニンコク | ヒモゲイトウ] | Amaranthus cruentus [Taxonomy_id: 117272, スギモリゲイトウ] | Anguilla anguilla [Taxonomy_id: 7936] | Arachis hypogaea [Taxonomy_id: 3818, ピーナッツ] | Artocarpus heterophyllus [Taxonomy_id: 3489] | Arum maculatum [Taxonomy_id: 4458] | Aspergillus kawachii IFO 4308 [Taxonomy_id: 1033177] | Aspergillus oryzae [Taxonomy_id: 5062, コウジカビ] | Balanus roseus [Taxonomy_id: 509123] | Balanus rostratus [Taxonomy_id: 399131, ミネフジツボ] | Bauhinia purpurea [Taxonomy_id: 3806] | Bitis arietans [Taxonomy_id: 8692] | Boletop.htmlsis leucomelas [Taxonomy_id: 178527, クロカワ] | Boletus [Taxonomy_id: 5369] | Bondarzewia mesenterica [Taxonomy_id: 1095465, ミヤマトンビマイ] | Bos taurus [Taxonomy_id: 9913, ウシ] | Bothrops jararaca [Taxonomy_id: 8724, ジャララカ] | Bufo arenarum [Taxonomy_id: 38577, 南アメリカヒキガエル] | Calystegia sepium [Taxonomy_id: 47519, ヒロハヒルガオ] | Canavalia brasiliensis [Taxonomy_id: 61861] | Canavalia ensiformis [Taxonomy_id: 3823] | Capsicum annuum [Taxonomy_id: 4072, トウガラシ] | Caragana arborescens [Taxonomy_id: 20484] | Castanea crenata [Taxonomy_id: 103480, クリ] | Ceratobasidium cornigerum [Taxonomy_id: 5252] | Chlorophyllum molybdites [Taxonomy_id: 34430, オオシロカラカサタケ] | Cicer arietinum [Taxonomy_id: 3827, ヒヨコマメ] | Clostridium botulinum [Taxonomy_id: 1491, ボツリヌス菌] | Colchicum autumnale [Taxonomy_id: 45005, イヌサフラン] | Conger myriaster [Taxonomy_id: 7943, アナゴ | マアナゴ] | Convolvulus arvensis [Taxonomy_id: 4123, セイヨウヒルガオ] | Cortinarius praestans [Taxonomy_id: 222043, ムレオオフウセンタケ] | Cratylia mollis [Taxonomy_id: 252530] | Crotalus atrox [Taxonomy_id: 8730] | Cucumaria echinata [Taxonomy_id: 40245] | Cycas revoluta [Taxonomy_id: 3396, ソテツ] | Cytisus scoparius [Taxonomy_id: 3835, エニシダ] | Datura stramonium [Taxonomy_id: 4076, シロバナヨウシュチョウセンアサガオ] | Dioclea grandiflora [Taxonomy_id: 3837] | Dioscorea batatas [Taxonomy_id: 55575, ダイジョ | ナガイモ] | Diospyros kaki [Taxonomy_id: 35925, カキ] | Dolichos lablab [Taxonomy_id: 35936] | Echis multisquamatus [Taxonomy_id: 93050] | Erythrina caffra [Taxonomy_id: 3842] | Erythrina corallodendron [Taxonomy_id: 3843, サンゴシトウ] | Erythrina crista-galli [Taxonomy_id: 49817, アメリカデイコ] | Erythrina lysistemon [Taxonomy_id: 347910] | Erythrina vespertilio [Taxonomy_id: 1234622] | Escherichia coli [Taxonomy_id: 562, 大腸菌] | Euonymus europaeus [Taxonomy_id: 123417] | Galanthus nivalis [Taxonomy_id: 4670, スノードロップ] | Gallus gallus [Taxonomy_id: 9031, ニワトリ] | Geodia cydonium [Taxonomy_id: 6047] | Giardia intestinalis [Taxonomy_id: 5741, 腸鞭毛虫] | Glycine max [Taxonomy_id: 3847, ダイズ] | Griffonia simplicifolia [Taxonomy_id: 3850] | Haemophilus ducreyi [Taxonomy_id: 730, 軟性下疳菌] | Halichondria okadai [Taxonomy_id: 163232, クロイソカイメン] | Helianthus tuberosus [Taxonomy_id: 4233, イヌキクイモ] | Helicobasidium purpureum [Taxonomy_id: 5574] | Helix aspersa [Taxonomy_id: 6535, プチグリ] | Helix pomatia [Taxonomy_id: 6536] | Hemitripterus americanus [Taxonomy_id: 8094] | Hericium erinaceum [Taxonomy_id: 91752, ヤマブシタケ] | Hippeastrum hybrid cultivar [Taxonomy_id: 679627] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Human herpesvirus 4 [Taxonomy_id: 10376, ヒトヘルペスウイルス4型] | Hydra vulgaris [Taxonomy_id: 6087] | Hypnea japonica [Taxonomy_id: 105606, カギイバラノリ] | Hypsizygus marmoreus [Taxonomy_id: 39966] | Laetiporus sulphureus [Taxonomy_id: 5630, アイカワタケ | マスタケ] | Lens culinaris [Taxonomy_id: 3864, レンズマメ] | Limax flavus [Taxonomy_id: 36461, キイロナメクジ | コウラナメクジ] | Limulus polyphemus [Taxonomy_id: 6850, アメリカカブトガニ] | Lotus tetragonolobus [Taxonomy_id: 3868] | Lumbricus terrestris [Taxonomy_id: 6398, ミミズ] | Lycoris traubii [Taxonomy_id: 82237, ショウキズイセン] | Maackia amurensis [Taxonomy_id: 37501, イヌエンジュ] | Maclura pomifera [Taxonomy_id: 3496] | Macrotyloma uniflorum [Taxonomy_id: 271171] | Momordica charantia [Taxonomy_id: 3673, ニガウリ] | Morus nigra [Taxonomy_id: 85232] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Musa acuminata [Taxonomy_id: 4641] | Narcissus pseudonarcissus [Taxonomy_id: 39639, ラッパズイセン] | Oncorhynchus keta [Taxonomy_id: 8018, シロザケ] | Oryza sativa [Taxonomy_id: 4530, イネ] | Parkia platycephala [Taxonomy_id: 185447] | Phaseolus lunatus [Taxonomy_id: 3884] | Phaseolus vulgaris [Taxonomy_id: 3885, インゲンマメ] | Phlebodium aureum [Taxonomy_id: 218620] | Phytolacca americana [Taxonomy_id: 3527, ヨウシュヤマゴボウ] | Pisum sativum [Taxonomy_id: 3888, エンドウ] | Plecoglossus altivelis [Taxonomy_id: 61084, アユ] | Pleurotus ostreatus [Taxonomy_id: 5322, ヒラタケ] | Polyandrocarpa misakiensis [Taxonomy_id: 7723] | Polygonatum multiflorum [Taxonomy_id: 45371] | Psathyrella velutina [Taxonomy_id: 71681, ムジナタケ] | Pseudomonas aeruginosa [Taxonomy_id: 287, 緑膿菌] | Psophocarpus tetragonolobus [Taxonomy_id: 3891] | Pteria penguin [Taxonomy_id: 113549, マベ | マベガイ] | Rana catesbeiana [Taxonomy_id: 8400, ウシガエル] | Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット] | Rattus rattus [Taxonomy_id: 10117, エジプトネズミ | クマネズミ] | Rhizoctonia solani [Taxonomy_id: 456999] | Ricinus communis [Taxonomy_id: 3988, トウゴマ] | Salvia viridis [Taxonomy_id: 49221] | Sambucus ebulus [Taxonomy_id: 28503] | Sambucus nigra [Taxonomy_id: 4202, セイヨウニワトコ] | Sambucus sieboldiana [Taxonomy_id: 45463, ニワトコ] | Scilla campanulata [Taxonomy_id: 81759] | Sclerotinia [Taxonomy_id: 5179, スクレロティニア属] | Silurus asotus [Taxonomy_id: 30991, ナマズ] | Sinularia lochmodes [Taxonomy_id: 301888] | Solanum lycopersicum [Taxonomy_id: 4081, トマト] | Solanum tuberosum [Taxonomy_id: 4113, ジャガイモ] | Sophora japonica [Taxonomy_id: 3897, エンジュ] | Spirinchus lanceolatus [Taxonomy_id: 136040, シシャモ] | Streptomyces lividans [Taxonomy_id: 1916, ストレプトマイセス・リビダンス] | Streptomyces olivaceoviridis [Taxonomy_id: 1921, ストレプトマイセス・オリバセオビリディス] | Sus scrofa [Taxonomy_id: 9823, イノシシ] | Tachypleus tridentatus [Taxonomy_id: 6853, カブトガニ] | Trichosanthes kirilowii var. japonica [Taxonomy_id: 61011, キカラスウリ] | Trimeresurus flavoviridis [Taxonomy_id: 88087] | Triticum aestivum [Taxonomy_id: 4565, コムギ] | Tulipa gesneriana [Taxonomy_id: 13306] | Ulex europaeus [Taxonomy_id: 3902, ハリエニシダ] | Urtica dioica [Taxonomy_id: 3501, セイヨウイラクサ] | Vicia faba [Taxonomy_id: 3906, ソラマメ] | Vicia villosa [Taxonomy_id: 3911, ビロードクサフジ] | Vigna radiata [Taxonomy_id: 157791, リョクトウ] | Viscum album [Taxonomy_id: 3972, セイヨウヤドリギ] | Wisteria floribunda [Taxonomy_id: 3922, フジ] | Xenopus laevis [Taxonomy_id: 8355, アフリカツメガエル]
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LigandBox

主な対象データ
低分子化合物立体構造
運用機関
大阪大学 | 産業技術総合研究所
生物種
なし
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MassBank

主な対象データ
マススペクトル
運用機関
慶應義塾大学
生物種
植物
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MassBase

主な対象データ
代謝産物
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
Acacia mangium | Arabidopsis thaliana | Cosmos bipinnatus | Acacia mangium [Taxonomy_id: 224085] | Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ] | Cosmos bipinnatus [Taxonomy_id: 51277, オオハルシャギク | コスモス] | Dicksonia antarctica [Taxonomy_id: 3271] | Escherichia coli [Taxonomy_id: 562, 大腸菌] | Glycine max [Taxonomy_id: 3847, ダイズ] | Hevea brasiliensis [Taxonomy_id: 3981, パラゴムノキ] | Jatropha curcas [Taxonomy_id: 180498] | Lotus japonicus [Taxonomy_id: 34305, ミヤコグサ] | Medicago sativa [Taxonomy_id: 3879, アルファルファ] | Medicago truncatula [Taxonomy_id: 3880, タルウマゴヤシ] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Nicotiana tabacum [Taxonomy_id: 4097, タバコ] | Saccharomyces cerevisiae [Taxonomy_id: 4932, 出芽酵母] | Solanum lycopersicum [Taxonomy_id: 4081, トマト] | Solanum pimpinellifolium [Taxonomy_id: 4084] | Thellungiella halophila [Taxonomy_id: 98038]
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MCG CNV Database

主な対象データ
DNA-多型 アレイ
運用機関
東京医科歯科大学
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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MEDALS

主な対象データ
メタデータ
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
全生物種
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mFAERS

主な対象データ
医薬品の有害事象
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
ヒト
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MFSearcher

主な対象データ
化合物
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
全生物種
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MiFuP

主な対象データ
DNA-配列 | アミノ酸配列 | アノテーション
運用機関
製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター
生物種
微生物-細菌
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MiFuP Safety

主な対象データ
DNA-配列 | アミノ酸配列 | アノテーション
運用機関
製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター
生物種
PubMed | UniProt | BioCyc | BRENDA | CAZy | HAMAP | HOGENOM | InterPro | KEGG | MEROPS | Pfam | PIRSF | PRINTS | ProDom | PROSITE | SMART | TCDB | TIGRFAMs | UniPathway
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MS-MS Fragment Viewer

主な対象データ
化合物 、マススペクトル
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
全生物種
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Multi-view Fractal DataBase

主な対象データ
静止画
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
なし
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NBRC (Biological Resource Center, NITE)

主な対象データ
各種データ
運用機関
製品評価技術基盤機構バイオテクノロジーセンター
生物種
全生物種
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NBRCオンラインカタログ検索

主な対象データ
DNA-配列
運用機関
製品評価技術基盤機構バイオテクノロジーセンター
生物種
微生物
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NITE-CHRIP

主な対象データ
化合物 化学物質
運用機関
製品評価技術基盤機構 化学物質管理センター
生物種
なし
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OpenPML

主な対象データ
DNA-多型
運用機関
バイオ産業情報化コンソーシアム | 日本DNAデータバンク
生物種
生物全般
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PCDq

主な対象データ
相互作用
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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PDB-REPRDB

主な対象データ
タンパク質-立体構造 タンパク質チェイン
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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Phosphorylation activity measurement-based pathway profiling database for drug-response

主な対象データ
タンパク質
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
ヒト
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PMPj-Blast

主な対象データ
DNA-配列 、EST-配列
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ] | Lotus japonicus [Taxonomy_id: 34305, ミヤコグサ]
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PoSSuM

主な対象データ
タンパク質-立体構造
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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PPI view

主な対象データ
タンパク質-プロテオーム
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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Properties Data base

主な対象データ
熱関連材料 | 基本的物質
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
なし
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ProSeg

主な対象データ
タンパク質-モチーフ
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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PRTRマップは排出量マップと濃度マップ

主な対象データ
排出量データ | 濃度データ
運用機関
製品評価技術基盤機構
生物種
なし
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RAvariome

主な対象データ
遺伝子/ゲノム多型
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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Recount DB

主な対象データ
RNA
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
Aplysia californica | Acyrthosiphon pisum | Arabidopsis lyrata | Acyrthosiphon pisum [Taxonomy_id: 7029, エンドウヒゲナガアブラムシ] | Aplysia californica [Taxonomy_id: 6500, ジャンボアメフラシ] | Arabidopsis lyrata [Taxonomy_id: 59689] | Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ] | Bacillus anthracis [Taxonomy_id: 1392, 炭疽菌] | Bombyx mori [Taxonomy_id: 7091, カイコ] | Bos taurus [Taxonomy_id: 9913, ウシ] | Brachypodium distachyon [Taxonomy_id: 15368] | Caenorhabditis elegans [Taxonomy_id: 6239, 線虫] | Candida albicans [Taxonomy_id: 5476, カンジダ・アルビカンス] | Cryptosporidium parvum [Taxonomy_id: 5807, クリプトスポリジウム・パルバム] | Dictyostelium discoideum [Taxonomy_id: 44689, キイロタマホコリカビ] | Dictyostelium purpureum [Taxonomy_id: 5786] | Drosophila melanogaster [Taxonomy_id: 7227, キイロショウジョウバエ] | Drosophila pseudoobscura [Taxonomy_id: 7237, ウスグロショウジョウバエ] | Drosophila simulans [Taxonomy_id: 7240, オナジショウジョウバエ] | Gallus gallus [Taxonomy_id: 9031, ニワトリ] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Listeria monocytogenes [Taxonomy_id: 1639, リステリア菌] | Macaca mulatta [Taxonomy_id: 9544, アカゲザル] | Medicago truncatula [Taxonomy_id: 3880, タルウマゴヤシ] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Nematostella vectensis [Taxonomy_id: 45351] | Oryza sativa [Taxonomy_id: 4530, イネ] | Pan troglodytes [Taxonomy_id: 9598, チンパンジー] | Plasmodium berghei [Taxonomy_id: 5821, プラスモディウム・ベルゲイ] | Plasmodium falciparum [Taxonomy_id: 5833, 熱帯熱マラリア原虫] | Plasmodium yoelii [Taxonomy_id: 5861, プラスモディウム・ヨエリ] | Prunus persica [Taxonomy_id: 3760, モモ] | Saccharomyces cerevisiae [Taxonomy_id: 4932, 出芽酵母] | Schmidtea mediterranea [Taxonomy_id: 79327] | Sus scrofa [Taxonomy_id: 9823, イノシシ] | Toxoplasma gondii [Taxonomy_id: 5811, トキソプラズマ原虫] | Trichoplax adhaerens [Taxonomy_id: 10228] | Triticum aestivum [Taxonomy_id: 4565, コムギ] | Zea mays [Taxonomy_id: 4577, トウモロコシ]
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RISCAD

主な対象データ
化学災害事例 |化学物質
運用機関
産業技術総合研究所 安全化学研究部門
生物種
全生物種
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Rminfo

主な対象データ
標準物質
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
なし
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RNAapt3D

主な対象データ
RNA 立体構造
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
なし
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RnR

主な対象データ
代謝産物
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ]
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SAHG

主な対象データ
タンパク質-立体構造
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
ヒト
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SARS(severe acute respiratory syndrome)-CoV2 Protein NMR Database

主な対象データ
タンパク質
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
コロナウイルス
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SEVENS

主な対象データ
タンパク質-配列 アミノ酸配列
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
Homo sapiens | Pan troglodytes | Gorilla gorilla | Anolis carolinensis [Taxonomy_id: 28377, ミドリアノール] | Anopheles gambiae [Taxonomy_id: 7165, ガンビアハマダラカ] | Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ] | Bos taurus [Taxonomy_id: 9913, ウシ] | Caenorhabditis brenneri [Taxonomy_id: 135651] | Caenorhabditis briggsae [Taxonomy_id: 6238, 線虫] | Caenorhabditis elegans [Taxonomy_id: 6239, 線虫] | Caenorhabditis remanei [Taxonomy_id: 31234] | Callithrix jacchus [Taxonomy_id: 9483, マーモセット] | Canis familiaris [Taxonomy_id: 9615, イヌ] | Cavia porcellus [Taxonomy_id: 10141, モルモット] | Ciona intestinalis [Taxonomy_id: 7719, ユウレイボヤ] | Danio rerio [Taxonomy_id: 7955, ゼブラフィッシュ] | Dasypus novemcinctus [Taxonomy_id: 9361, ココノオビアルマジロ] | Dictyostelium discoideum [Taxonomy_id: 44689, キイロタマホコリカビ] | Drosophila melanogaster [Taxonomy_id: 7227, キイロショウジョウバエ] | Drosophila simulans [Taxonomy_id: 7240, オナジショウジョウバエ] | Drosophila yakuba [Taxonomy_id: 7245, ヤクバショウジョウバエ] | Echinops telfairi [Taxonomy_id: 9371, ヒメハリテンレック] | Erinaceus europaeus [Taxonomy_id: 9365, ナミハリネズミ | ヨーロッパハリネズミ] | Felis catus [Taxonomy_id: 9685, ネコ] | Gallus gallus [Taxonomy_id: 9031, ニワトリ] | Gasterosteus aculeatus [Taxonomy_id: 69293, イトヨ] | Gorilla gorilla [Taxonomy_id: 9593, ゴリラ] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Loxodonta africana [Taxonomy_id: 9785, アフリカゾウ] | Macaca mulatta [Taxonomy_id: 9544, アカゲザル] | Macropus eugenii [Taxonomy_id: 9315, ダマヤブワラビー] | Monodelphis domestica [Taxonomy_id: 13616, ハイイロジネズミオポッサム] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Myotis lucifugus [Taxonomy_id: 59463, トビイロホオヒゲコウモリ] | Ochotona princeps [Taxonomy_id: 9978, アメリカナキウサギ] | Ornithorhynchus anatinus [Taxonomy_id: 9258, カモノハシ] | Oryctolagus cuniculus [Taxonomy_id: 9986, ウサギ] | Oryza sativa [Taxonomy_id: 4530, イネ] | Oryzias latipes [Taxonomy_id: 8090, メダカ] | Otolemur garnettii [Taxonomy_id: 30611, ガーネットガラゴ] | Pan troglodytes [Taxonomy_id: 9598, チンパンジー] | Papio hamadryas [Taxonomy_id: 9557, マントヒヒ] | Petromyzon marinus [Taxonomy_id: 7757, ヤツメウナギ] | Pongo abelii [Taxonomy_id: 9601, スマトラオランウータン] | Procavia capensis [Taxonomy_id: 9813, イワダヌキ | ケープハイラックス] | Pteropus vampyrus [Taxonomy_id: 132908, ジャワオオコウモリ] | Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット] | Saccharomyces cerevisiae [Taxonomy_id: 4932, 出芽酵母] | Sorex araneus [Taxonomy_id: 42254, ヨーロッパトガリネズミ] | Spermophilus tridecemlineatus [Taxonomy_id: 43179, ジュウサンセンジリス] | Taeniopygia guttata [Taxonomy_id: 59729, キンカチョウ] | Takifugu rubripes [Taxonomy_id: 31033, トラフグ] | Tarsius syrichta [Taxonomy_id: 9478, フィリピンメガネザル] | Tetraodon nigroviridis [Taxonomy_id: 99883] | Tupaia belangeri [Taxonomy_id: 37347] | Tursiops truncatus [Taxonomy_id: 9739, バンドウイルカ] | Vicugna pacos [Taxonomy_id: 30538] | Xenopus tropicalis [Taxonomy_id: 8364, ゼノパス・トロピカリス]
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TMBETA-DISC

主な対象データ
タンパク質-アミノ酸特性
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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TMBETA-GENOME

主な対象データ
タンパク質-立体構造
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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TMFunction

主な対象データ
タンパク質-立体構造 、機能残基
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
Homo sapiens | Escherichia coli | xenopus | Bacillus halodurans [Taxonomy_id: 86665, バチルス・ハロデュランス] | Bacteriophage M13 [Taxonomy_id: 10870, バクテリオファージM13] | Bordetella pertussis [Taxonomy_id: 520, 百日咳菌] | Bos taurus [Taxonomy_id: 9913, ウシ] | Carassius auratus [Taxonomy_id: 7957, キンギョ] | Clostridium botulinum [Taxonomy_id: 1491, ボツリヌス菌] | Corynebacterium diphtheriae [Taxonomy_id: 1717, ジフテリア菌] | Cricetulus griseus [Taxonomy_id: 10029, モンゴルキヌゲネズミ] | Danio rerio [Taxonomy_id: 7955, ゼブラフィッシュ] | Emericella nidulans [Taxonomy_id: 162425] | Escherichia coli [Taxonomy_id: 562, 大腸菌] | Escherichia coli O157 [Taxonomy_id: 1045010, 大腸菌O157] | Escherichia coli UTI89 [Taxonomy_id: 364106, 大腸菌] | Gallus gallus [Taxonomy_id: 9031, ニワトリ] | Helicobacter pylori [Taxonomy_id: 210, ピロリ菌] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Human herpesvirus 8 [Taxonomy_id: 37296, ヒトヘルペスウイルス8型] | Leishmania donovani [Taxonomy_id: 5661, ドノバンリーシュマニア] | Manduca sexta [Taxonomy_id: 7130, タバコスズメガ] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Oryctolagus cuniculus [Taxonomy_id: 9986, ウサギ] | Pongo pygmaeus [Taxonomy_id: 9600, ボルネオオランウータン] | Pseudomonas aeruginosa [Taxonomy_id: 287, 緑膿菌] | Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット] | Rhodobacter sphaeroides [Taxonomy_id: 1063, ロドバクター・スフェロイデス] | Rhodopseudomonas blastica [Taxonomy_id: 1075] | Saccharomyces cerevisiae [Taxonomy_id: 4932, 出芽酵母] | Saimiri boliviensis [Taxonomy_id: 27679, ボリビアリスザル] | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium [Taxonomy_id: 90371, サルモネラ菌] | Shigella dysenteriae [Taxonomy_id: 622, 志賀赤痢菌] | Staphylococcus aureus [Taxonomy_id: 1280, 黄色ブドウ球菌] | Vibrio parahaemolyticus [Taxonomy_id: 670, 腸炎ビブリオ] | Xenopus [Taxonomy_id: 8353, ツメガエル] | Xenopus laevis [Taxonomy_id: 8355, アフリカツメガエル]
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TOT-DB

主な対象データ
比較ゲノム
運用機関
北海道大学 人獣共通感染症リサーチセンター
生物種
Theileria orientalis, Theileria parva, Theileria annulata
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ToxBay

主な対象データ
化合物 毒性情報
運用機関
関西学院大学
生物種
脊椎動物-哺乳類-ラット
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toxBridge

主な対象データ
ラット|人|in vivo | in vitro
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
ヒト|ラット
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TraP

主な対象データ
代謝産物
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
Aeropyrum pernix | Archaeoglobus fulgidus | Pyrococcus abyssi | Aeropyrum pernix [Taxonomy_id: 56636, アエロパイラム・ペルニクス] | Archaeoglobus fulgidus [Taxonomy_id: 2234, アーケオグロブス・フルギダス] | Methanobacterium thermoautotrophicum [Taxonomy_id: 145262] | Methanococcus jannaschii [Taxonomy_id: 2190, メタノカルドコッカス・ジャナスキイ] | Pyrococcus abyssi [Taxonomy_id: 29292, パイロコッカス・アビシ] | Pyrococcus horikoshii OT3 [Taxonomy_id: 70601, パイロコッカス・ホリコシイ] | Thermoplasma volcanium [Taxonomy_id: 50339]
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TuMaRdb

主な対象データ
糖鎖 マーカー
運用機関
産業技術総合研究所 糖鎖医工学研究センター
生物種
全生物種
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VarySysDB

主な対象データ
DNA-多型
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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アカシアESTデータベース

主な対象データ
DNA-配列 EST
運用機関
京都大学
生物種
Acacia mangium [Taxonomy_id: 224085, アカシア]
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グリコシダーゼデータベース

主な対象データ
グリコシダーゼ
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
なし
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コントラスト感度

主な対象データ
視覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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スペクトルデータベース

主な対象データ
有機化合物のスペクトルデータ
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
なし
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テレビの聴取音量

主な対象データ
聴覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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ミヤコグサEST・完全長配列

主な対象データ
DNA-配列
運用機関
かずさDNA研究所
生物種
Lotus japonicus [Taxonomy_id: 34305, ミヤコグサ]
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ラットの脳断面図

主な対象データ
形態 画像
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット]
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人体特性文献データベース

主な対象データ
文献情報
運用機関
産業技術総合研究所 人工知能研究センター
生物種
ヒト
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介護の構造化マニュアル

主な対象データ
介護の構造
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
ヒト
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低周波音に対する閾値

主な対象データ
聴覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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健常人マイクロバイオームデータベース

主な対象データ
不明
運用機関
日本マイクロバイオームコンソーシアム
生物種
なし
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分散型熱物性データベース

主な対象データ
熱物性データ
運用機関
産業技術総合研究所 物質計測標準研究部門
生物種
なし
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創薬支援インフォマティクスシステム構築プロジェクト (毒性関連ポータルサイト)

主な対象データ
メタデータ
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
ヒト
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化学物質の有害性評価書

主な対象データ
化合物
運用機関
化学物質評価研究機構
生物種
ヒト、藻類、甲殻類、魚類
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化審法データベース

主な対象データ
化合物 |化学物質
運用機関
製品評価技術基盤機構 化学物質管理センター
生物種
なし
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単語の正聴率

主な対象データ
聴覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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可読文字サイズ

主な対象データ
視覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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固体NMRスペクトルデータベース

主な対象データ
化合物 化学物質
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
なし
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基本色領域に基づく色の組合わせ

主な対象データ
視覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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報知音の音圧レベル

主な対象データ
聴覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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大腸菌マルチオミクス データベース

主な対象データ
遺伝子発現 、タンパク質、代謝物質
運用機関
慶應義塾大学
生物種
Escherichia coli [Taxonomy_id: 562, 大腸菌]
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天然物ライブラリー

主な対象データ
天然化学物質
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
なし
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年代別輝度コントラスト

主な対象データ
視覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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年齢別聴覚閾値分布(ISO 7029準拠)

主な対象データ
聴覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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年齢別聴覚閾値分布(日本人データ)

主な対象データ
聴覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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微生物データベースシステム

主な対象データ
文献 旧名(もしあれば)、系統的位置、type strain、分離源、化学分類指標になる各種化学成分、基質利用性、エネルギー獲得様式、16S rDNAのDDBJ/EMBL/GenBankなどへのaccession numberなど
運用機関
産業技術総合研究所 生物機能工学研究部門
生物種
微生物-細菌
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微生物有害情報データベース

主な対象データ
微生物の危険度/有害性の情報 | DNA-配列 | アミノ酸配列
運用機関
製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター
生物種
細菌、真菌
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微生物有害情報リスト

主な対象データ
微生物の危険度 | 有害性の情報
運用機関
製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター
生物種
細菌 |真菌
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微細藻類遺伝子工学データベース

主な対象データ
DNA-制御領域
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
Anabaena sp. | Nostoc sp. | Synechococcus sp. | Anabaena sp. [Taxonomy_id: 1167] | Anabaena sp. PCC 7118 [Taxonomy_id: 93135] | Chlamydomonas reinhardtii [Taxonomy_id: 3055, コナミドリムシ] | Chlorella sorokiniana [Taxonomy_id: 3076] | Euglena gracilis [Taxonomy_id: 3039, ユーグレナ・グラシリス] | Fischerella muscicola [Taxonomy_id: 92938] | Fremyella diplosiphon [Taxonomy_id: 1197] | Leptolyngbya boryana PCC 6306 [Taxonomy_id: 272134] | Nostoc punctiforme PCC 73102 [Taxonomy_id: 63737] | Nostoc sp. [Taxonomy_id: 1180] | Nostoc sp. PCC 6720 [Taxonomy_id: 34077] | Nostoc sp. PCC 7107 [Taxonomy_id: 317936] | Nostoc sp. PCC 7120 [Taxonomy_id: 103690] | Nostoc sp. PCC 7121 [Taxonomy_id: 197230] | Nostoc sp. PCC 7416 [Taxonomy_id: 889396] | Nostoc sp. PCC 7524 [Taxonomy_id: 28072] | Phaeodactylum tricornutum [Taxonomy_id: 2850] | Plectonema boryanum [Taxonomy_id: 1184] | Spirulina platensis [Taxonomy_id: 118562] | Synechococcus elongatus PCC 7942 [Taxonomy_id: 1140] | Synechococcus sp. NKBG 042902 [Taxonomy_id: 490193] | Synechococcus sp. PCC 6301 [Taxonomy_id: 269084] | Synechococcus sp. PCC 7002 [Taxonomy_id: 32049] | Synechocystis sp. PCC 6803 [Taxonomy_id: 1148]
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手の寸法データベース

主な対象データ
手のデータ
運用機関
産業技術総合研究所 人工知能研究センター
生物種
ヒト
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政府によるGHS分類結果

主な対象データ
化合物|化学物質
運用機関
製品評価技術基盤機構 化学物質管理センター
生物種
なし
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文章の文字間・行間余白設計

主な対象データ
視覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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日本人頭部寸法データベース2001

主な対象データ
頭部のデータ
運用機関
産業技術総合研究所 人工知能研究センター
生物種
ヒト
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日本古生物標本横断データベース

主な対象データ
古生物標本
運用機関
九州大学総合研究博物館、産業技術総合研究所
生物種
古生物
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最小可読文字サイズ・コントラスト

主な対象データ
視覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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核酸医薬品データベース

主な対象データ
核酸医薬品
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
なし
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機能性RNAゲノムブラウザー

主な対象データ
比較ゲノム
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
Homo sapiens | Rattus norvegicus | Drosophila melanogaster | Aspergillus oryzae [Taxonomy_id: 5062, コウジカビ] | Bombyx mori [Taxonomy_id: 7091, カイコ] | Caenorhabditis elegans [Taxonomy_id: 6239, 線虫] | Ciona intestinalis [Taxonomy_id: 7719, ユウレイボヤ] | Drosophila melanogaster [Taxonomy_id: 7227, キイロショウジョウバエ] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット] | Saccharomyces cerevisiae [Taxonomy_id: 4932, 出芽酵母]
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機能性RNA配列データベース

主な対象データ
RNA
運用機関
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
生物種
全生物種
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正常臓器 遺伝子発現データベース

主な対象データ
病気-ガン 遺伝子発現
運用機関
東京大学 エピゲノム&シグナリングクラスター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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環境微生物データベースプロジェクト

主な対象データ
不明
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
不明
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糸状菌ゲノム・転写制御データベース

主な対象データ
DNA-配列
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
Aspergillus oryzae [Taxonomy_id: 5062, コウジカビ] | Aspergillus nidulans [Taxonomy_id: 162425, アスペルギルス・ニデュランス]
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統合がんゲノムデータベース

主な対象データ
DNA-多型
運用機関
がん研究会 ゲノムセンター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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脳画像データベース

主な対象データ
形態 、MRI画像
運用機関
産業技術総合研究所 脳神経情報研究部門
生物種
Macaca fuscata [Taxonomy_id: 9542, ニホンザル] | Macaca mulatta [Taxonomy_id: 9544, アカゲザル] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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視標検出視野(視標の検出率)

主な対象データ
視覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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視標検出視野(視野範囲)

主な対象データ
視覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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触覚記号・文字の判読率

主な対象データ
触覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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遺伝子多様性データベース公開システム(H-GOLD)

主な対象データ
DNA-多型 、マイクロサテライト、SNP
運用機関
産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
生物種
Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
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音の大きさの等感曲線

主な対象データ
聴覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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音声アナウンスの聴取音量

主な対象データ
聴覚データ
運用機関
産業技術総合研究所 ヒューマンライフテクノロジー研究部門
生物種
ヒト
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高エネルギー化学物質 物性ファクトデータベース

主な対象データ
実験値
運用機関
産業技術総合研究所 安全化学研究部門
生物種
なし
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高エネルギー物質 結晶構造データベース

主な対象データ
結晶構造
運用機関
産業技術総合研究所 安全化学研究部門
生物種
なし
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高齢者行動ライブラリ

主な対象データ
動画
運用機関
産業技術総合研究所
生物種
ヒト
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