成果物名 SEVENS
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

GPCR遺伝子の網羅的データベースです。7本膜貫通ヘリックス型タンパク質のGPCR遺伝子を網羅的に収めたデータベースです。32の真核生物のゲノムからバイオインフォマティクス手法で、遺伝子を高精度に同定しています。

成果物のタイプ DB
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://sevens.cbrc.jp/
インターフェイス GUI
入力例

生物種を選択し、キーワードを検索テキストボックスに入力、[submit]ボタンを押します。Chromosome Number、Exon Number、Protein Length、Pseudogene、Familyを選択可能です。

キーワード
GPCR (G-protein coupled receptor) | Odorant/olfactory and gustatory receptors | Chemokines and chemotactic factors receptors | taste receptors | metabotropic glutamate and calcium receptors | Insect chemosensory receptors | Opsins | Nematode chemoreceptors | Serpentine receptor-like proteins | Sre proteins | Plant MLO receptors | slime mold receptors | Archaeal/bacterial/fungal opsin family | fungal receptors | BLAST | SOSUI | ALN | HMMER | Anopheles gambiae (マラリア媒介蚊) | Saccharomyces cerevisiae (清酒酵母)
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 "7,000|現在一括ダウンロード不可。"
使っている外部リソース NCBI | KEGG | SWISS-Prot | Pfam
主な対象データ タンパク質-配列 アミノ酸配列
生物種
"Homo sapiens | Pan troglodytes | Gorilla gorilla | ... More
  • Anolis carolinensis [Taxonomy_id: 28377, ミドリアノール]
  • Anopheles gambiae [Taxonomy_id: 7165, ガンビアハマダラカ]
  • Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ]
  • Bos taurus [Taxonomy_id: 9913, ウシ]
  • Caenorhabditis brenneri [Taxonomy_id: 135651]
  • Caenorhabditis briggsae [Taxonomy_id: 6238, 線虫]
  • Caenorhabditis elegans [Taxonomy_id: 6239, 線虫]
  • Caenorhabditis remanei [Taxonomy_id: 31234]
  • Callithrix jacchus [Taxonomy_id: 9483, マーモセット]
  • Canis familiaris [Taxonomy_id: 9615, イヌ]
  • Cavia porcellus [Taxonomy_id: 10141, モルモット]
  • Ciona intestinalis [Taxonomy_id: 7719, ユウレイボヤ]
  • Danio rerio [Taxonomy_id: 7955, ゼブラフィッシュ]
  • Dasypus novemcinctus [Taxonomy_id: 9361, ココノオビアルマジロ]
  • Dictyostelium discoideum [Taxonomy_id: 44689, キイロタマホコリカビ]
  • Drosophila melanogaster [Taxonomy_id: 7227, キイロショウジョウバエ]
  • Drosophila simulans [Taxonomy_id: 7240, オナジショウジョウバエ]
  • Drosophila yakuba [Taxonomy_id: 7245, ヤクバショウジョウバエ]
  • Echinops telfairi [Taxonomy_id: 9371, ヒメハリテンレック]
  • Erinaceus europaeus [Taxonomy_id: 9365, ナミハリネズミ | ヨーロッパハリネズミ]
  • Felis catus [Taxonomy_id: 9685, ネコ]
  • Gallus gallus [Taxonomy_id: 9031, ニワトリ]
  • Gasterosteus aculeatus [Taxonomy_id: 69293, イトヨ]
  • Gorilla gorilla [Taxonomy_id: 9593, ゴリラ]
  • Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
  • Loxodonta africana [Taxonomy_id: 9785, アフリカゾウ]
  • Macaca mulatta [Taxonomy_id: 9544, アカゲザル]
  • Macropus eugenii [Taxonomy_id: 9315, ダマヤブワラビー]
  • Monodelphis domestica [Taxonomy_id: 13616, ハイイロジネズミオポッサム]
  • Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス]
  • Myotis lucifugus [Taxonomy_id: 59463, トビイロホオヒゲコウモリ]
  • Ochotona princeps [Taxonomy_id: 9978, アメリカナキウサギ]
  • Ornithorhynchus anatinus [Taxonomy_id: 9258, カモノハシ]
  • Oryctolagus cuniculus [Taxonomy_id: 9986, ウサギ]
  • Oryza sativa [Taxonomy_id: 4530, イネ]
  • Oryzias latipes [Taxonomy_id: 8090, メダカ]
  • Otolemur garnettii [Taxonomy_id: 30611, ガーネットガラゴ]
  • Pan troglodytes [Taxonomy_id: 9598, チンパンジー]
  • Papio hamadryas [Taxonomy_id: 9557, マントヒヒ]
  • Petromyzon marinus [Taxonomy_id: 7757, ヤツメウナギ]
  • Pongo abelii [Taxonomy_id: 9601, スマトラオランウータン]
  • Procavia capensis [Taxonomy_id: 9813, イワダヌキ | ケープハイラックス]
  • Pteropus vampyrus [Taxonomy_id: 132908, ジャワオオコウモリ]
  • Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット]
  • Saccharomyces cerevisiae [Taxonomy_id: 4932, 出芽酵母]
  • Sorex araneus [Taxonomy_id: 42254, ヨーロッパトガリネズミ]
  • Spermophilus tridecemlineatus [Taxonomy_id: 43179, ジュウサンセンジリス]
  • Taeniopygia guttata [Taxonomy_id: 59729, キンカチョウ]
  • Takifugu rubripes [Taxonomy_id: 31033, トラフグ]
  • Tarsius syrichta [Taxonomy_id: 9478, フィリピンメガネザル]
  • Tetraodon nigroviridis [Taxonomy_id: 99883]
  • Tupaia belangeri [Taxonomy_id: 37347]
  • Tursiops truncatus [Taxonomy_id: 9739, バンドウイルカ]
  • Vicugna pacos [Taxonomy_id: 30538]
  • Xenopus tropicalis [Taxonomy_id: 8364, ゼノパス・トロピカリス]
"
利用条件 表示-非営利-継承アカウント不必要
データ更新頻度 (過去2年間) 2
最終更新日(調査日) 2014/02/24 (2014/02/12)
利用できるID
CBRC-species-2digit numbers-4digit numbers
IDを使った成果物の利用方法 EA-UM1Vdetail.php?db=[生物種]&chr=[染色体番号]&l=1&r=1053750&twin=0&id=[ID]
外部リンク

"ExPASy Proteomics Server(http://www.expasy.org/), NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/), Pfam(http://pfam.sanger.ac.uk/)"

論文等(PubMed ID)

pmid:16126348 | pmid:19718507