GENIUS II
成果物名 | GENIUS II |
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成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | 多重媒介配列検索法(MISS法)を用いて各生物種ゲノムの全ORFを構造既知のタンパク質の立体構造に帰属したデータベースシステムです。 |
成果物のタイプ | DB |
運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/genius/desc.html |
インターフェイス | GUI |
入力例 | 配列もしくはキーワードを検索テキストボックスに入力し、生物界を指定し、[Send]ボタンを押しす。 |
キーワード | 配列アラインメント|Multiple Intermediate Sequence Search (MISS)|PDB|PSI-BLAST |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 0|なし |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | タンパク質-配列 アミノ酸配列 |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | 表示-継承 |
データ更新頻度 (過去2年間) | 1 |
最終更新日(調査日) | 2017/10/11 (2019/07/02) 運用終了、アーカイブ化 |
利用できるID | Gene name |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | なし |
論文等(PubMed ID) | pmid:10195280 | pmid:10211823 | pmid:14751990 | Suwa, M., Salamov AA, Nishikawa, T. and Swindells, M. B. "GoodMotif: The system for finding high quality motifs that can discriminate an unique family." Genome Informatics Series, 8, pp342-343, (1997). |
稼働状況 | アーカイブ化 |