全ツールリスト
A Method for Extracting Optimal Sequence Related to Biological Activity
- 主な対象データ
- DNA-モチーフ
- 運用機関
- 奈良先端科学技術大学院大学
- 生物種
- 全生物種
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ADMER2
- 主な対象データ
- 化合物 対象年のアメダスデータ(CD-ROM)、または、Version 2.5からは対象年のADMER専用アメダスデータ・・・気象データ作成に利用 * 対象化学物質の排出量に関するデータ(点源排出量、県別・市町村別排出量等) ・・・グリッド排出量データ作成に利用
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 安全化学研究部門
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- 排出量と簡単な物性を入力データとして用意すれば、化学物質の大気中濃度と地表への沈着量の分布を、詳細な空間解像度(5kmから100m四方格子)で推定。
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 安全化学研究部門
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- 化学物質
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 安全化学研究部門
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- 化学物質
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 安全化学研究部門
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- 気象データ、化学物質の排出量、基本的な物性(分子量、蒸気圧、水溶解度、Koc、半減期)
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 安全化学研究部門
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- 化学物質
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 安全化学研究部門
- 生物種
- 魚類
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- 主な対象データ
- DNA配列、アミノ酸配列
- 運用機関
- 京都大学大学院 情報学研究科
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- DNA-配列 、ゲノム
- 運用機関
- 京都大学大学院 情報学研究科
- 生物種
- 脊椎動物
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ASIAN
- 主な対象データ
- 遺伝子発現 プロファイル
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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BioDBScan
- 主な対象データ
- 遺伝子、パスウェイ、疾患など
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- ヒト、マウス、ラット、ホヤ
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- 主な対象データ
- 代謝産物
- 運用機関
- 九州工業大学
- 生物種
- 全生物種
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CentroidAlifold
- 主な対象データ
- RNA 二次構造
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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CentroidAlign
- 主な対象データ
- RNA アラインメント
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- RNA
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- 二次構造
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- DNA-配列 , RNA-配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
- 生物種
- 全生物種
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CoCoozo
- 主な対象データ
- タンパク質-配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- 遺伝子
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
- 生物種
- 全生物種
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DAFS
- 主な対象データ
- RNA
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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Dnemulator
- 主な対象データ
- DNA-配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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DPClus
- 主な対象データ
- タンパク質-機能
- 運用機関
- 奈良先端科学技術大学院大学
- 生物種
- 全生物種
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Dr DMASS
- 主な対象データ
- マススペクトル
- 運用機関
- 奈良先端科学技術大学院大学
- 生物種
- 全生物種
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Dr DMASS+
- 主な対象データ
- マススペクトル
- 運用機関
- 奈良先端科学技術大学院大学
- 生物種
- 全生物種
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fastapl
- 主な対象データ
- DNA-配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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Fdur
- 主な対象データ
- RNA
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- タンパク質-立体構造
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- 代謝産物 、マススペクトル
- 運用機関
- かずさDNA研究所
- 生物種
- 全生物種
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GeneDecoder
- 主な対象データ
- DNA-配列 、真核生物の遺伝子
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 真核生物
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GPCRs Interaction Partners
- 主な対象データ
- 相互作用 GPCR
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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GRIFFIN
- 主な対象データ
- タンパク質-配列 、アミノ酸配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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GRisk
- 主な対象データ
- 疾患リスク
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- DNA-配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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HapRisk
- 主な対象データ
- 発現リスク
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- アノテーション
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- 脊椎動物-哺乳類-ヒト
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- 主な対象データ
- 化合物 毒性情報
- 運用機関
- 製品評価技術基盤機構 化学物質管理センター
- 生物種
- 脊椎動物-哺乳類-ラット
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- 主な対象データ
- タンパク質-アミノ酸配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
- 生物種
- 全生物種
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Idiographica
- 主な対象データ
- 染色体
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 脊椎動物-哺乳類-ヒト、マウス、ラット、ハエ
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- 主な対象データ
- データ識別子(ID)
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- 脊椎動物-哺乳類-ヒト
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- 主な対象データ
- ID識別子
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- 脊椎動物-哺乳類-ヒト、マウス、化合物データも含む
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- 主な対象データ
- RNA 偽結び目構造
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- 遺伝子発現
- 運用機関
- かずさDNA研究所
- 生物種
- 植物-シロイヌナズナ
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KaPPA-View
- 主な対象データ
- 代謝産物 遺伝子発現
- 運用機関
- かずさDNA研究所
- 生物種
- 植物-シロイヌナズナ、イネ、トマト、ミヤコグサ
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- 主な対象データ
- 代謝産物 パスウェイ
- 運用機関
- かずさDNA研究所
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- 多重検定による統計的有意性
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- DNA-配列 , RNA-配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- DNA-配列 RNA、タンパク質、ユーザー任意のアルファベット
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- DNA-配列 アラインメント
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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MDV
- 主な対象データ
- DNA-モチーフ
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- ヒト、マウスがサイト上で利用可能
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miRRim
- 主な対象データ
- RNA (miRNA)
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- タンパク質-アミノ酸配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
- 生物種
- 菌類、植物、後生動物
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Murlet
- 主な対象データ
- RNA
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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MXSCARNA
- 主な対象データ
- RNA (RNA配列)
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- タンパク質-立体構造
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- 全生物種
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NGSFeatGen
- 主な対象データ
- DNA-配列 NGS
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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PAPIA
- 主な対象データ
- タンパク質-立体構造
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- DNA-配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
解説ページ →
- 主な対象データ
- RNA
- 運用機関
- 慶應義塾大学 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- 文献
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- なし
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- 主な対象データ
- タンパク質-アミノ酸特性
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- マススペクトルデータ
- 運用機関
- かずさDNA研究所
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- DNA配列、アミノ酸配列
- 運用機関
- 京都大学大学院 情報学研究科
- 生物種
- 全生物種
解説ページ →
- 主な対象データ
- RNA
- 運用機関
- 慶應義塾大学 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
解説ページ →
- 主な対象データ
- PubMedに登録されている文献
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- なし
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- 主な対象データ
- RNA
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- RNA RNA-RNA インタラクション
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- RNA
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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Recount
- 主な対象データ
- DNA-配列 次世代シーケンサーデータ
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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Rentropy
- 主な対象データ
- RNA
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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Rfold
- 主な対象データ
- RNA
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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RNAmine
- 主な対象データ
- RNA RNA配列群
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター | みずほ情報総研株式会社
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- 遺伝子発現
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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Scarna
- 主な対象データ
- RNA
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
解説ページ →
SCARNA Local Multiple
- 主な対象データ
- RNA アラインメント
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- タンパク質-アミノ酸配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
- 生物種
- 後生動物
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- 主な対象データ
- DNA-配列 , RNA-配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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SGCAL
- 主な対象データ
- 糖鎖
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
解説ページ →
- 主な対象データ
- RNA siRNA
- 運用機関
- 東京大学大学院工学系研究科 化学生命工学専攻
- 生物種
- ヒト
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- 主な対象データ
- DNA-配列 タンパク質-配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
解説ページ →
- 主な対象データ
- タンパク質配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 環境管理研究部門
- 生物種
- なし
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- 主な対象データ
- DNA-配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- 遺伝子発現
- 運用機関
- かずさDNA研究所
- 生物種
- 全生物種
解説ページ →
SOKOS/CAN
- 主な対象データ
- RNA RNA配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
解説ページ →
- 主な対象データ
- 比較ゲノム
- 運用機関
- 京都大学大学院 情報学研究科
- 生物種
- 全生物種
解説ページ →
- 主な対象データ
- 代謝産物
- 運用機関
- かずさDNA研究所
- 生物種
- 全生物種
解説ページ →
Stem Kernels
- 主な対象データ
- RNA
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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TACT
- 主な対象データ
- DNA-配列
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- 脊椎動物-哺乳類-ヒトヒト以外の41生物種(http://h-invitational.jp/tact/species.html)
解説ページ →
- 主な対象データ
- DNA-配列 、RNA、 アミノ酸
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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THE MICROARRAY ANALYSIS SYSTEM - TREBAX -
- 主な対象データ
- 遺伝子発現 マイクロアレイデータ
- 運用機関
- 奈良先端科学技術大学院大学
- 生物種
- 全生物種
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TMBETA-NET
- 主な対象データ
- タンパク質-モチーフ
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 全生物種
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- 主な対象データ
- 化合物
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- 人|ラット
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- 主な対象データ
- タンパク質-配列 真核生物の核ゲノムにコードされている蛋白質
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
- 生物種
- 真核生物
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- 主な対象データ
- ワークフロー
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- 全生物種
解説ページ →
- 主な対象データ
- タンパク質立体構造
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 環境管理研究部門
- 生物種
- なし
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- 主な対象データ
- データ識別子(ID)
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- 脊椎動物-哺乳類-ヒトマウス | ラット | ホヤ
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- 主な対象データ
- DNA-配列
- 運用機関
- 広島大学
- 生物種
- 微生物-酵母
解説ページ →
- 主な対象データ
- 化合物
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 安全化学研究部門
- 生物種
- ヒト
解説ページ →
更新検知ツール
- 主な対象データ
- Webページ
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
- 生物種
- なし
解説ページ →
水系暴露解析モデル (公開保留 (idb G1:2626))
- 主な対象データ
- 化合物
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 安全化学研究部門
- 生物種
- 不特定
解説ページ →
- 主な対象データ
- 薬量、距離
- 運用機関
- 産業技術総合研究所 安全化学研究部門
- 生物種
- なし
解説ページ →
- 主な対象データ
- 化合物
- 運用機関
- 化学物質評価研究機構
- 生物種
- ラット
解説ページ →