成果物名 | MAFFT |
成果物の別名 | Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences |
成果物に関する説明 | MAFFTはUNIX系OSで稼働する多重アラインメントプログラムです。このプログラムはL-INS-iやFFT-NS-2などの範囲で多重アラインメント法が利用できます。ダウンロード版(MacOS X用、Windows用、Linux用、Sourceファイル)とオンライン版を提供しています。(オリジナルサイトから翻訳) |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | http://mafft.cbrc.jp/alignment/software/ |
インターフェイス | GUI | CUI |
入力 | 塩基 もしくは アミノ酸配列(FASTAフォーマット) |
出力 | |
入力例 | 多重アラインメント作成では次の様に入力する:mafft [options] input_seq (FASTA format) > output_seq |
キーワード | 多重アラインメント | L-INS-i | FFT-NS-2 |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 15.8|http://mafft.cbrc.jp/alignment/software/ からファイルダウンロード |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | DNA-配列 アラインメント |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | GPL |
データ更新頻度 (過去2年間) | 29 |
最終更新日(調査日) | 2019/05/00 (2019/06/03) |
利用できるID | N/A |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | N/A |
論文等(PubMed ID) | pmid:23329690 | pmid:23023983 | pmid:20427515 | pmid:19378139 | pmid:18439255 | pmid:18372315 | pmid:17118958 | pmid:15661851 | pmid:12136088 | pmid:23329690 |
稼働状況 | 公開中 |