成果物名 MAFFT
成果物の別名 Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
成果物に関する説明

MAFFTはUNIX系OSで稼働する多重アラインメントプログラムです。このプログラムはL-INS-iやFFT-NS-2などの範囲で多重アラインメント法が利用できます。ダウンロード版(MacOS X用、Windows用、Linux用、Sourceファイル)とオンライン版を提供しています。(オリジナルサイトから翻訳)

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://mafft.cbrc.jp/alignment/software/
インターフェイス GUI | CUI
入力

塩基 もしくは アミノ酸配列(FASTAフォーマット)

出力

入力例

多重アラインメント作成では次の様に入力する:mafft [options] input_seq (FASTA format) > output_seq

キーワード
多重アラインメント | L-INS-i | FFT-NS-2
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 15.8|http://mafft.cbrc.jp/alignment/software/ からファイルダウンロード
使っている外部リソース なし
主な対象データ DNA-配列 アラインメント
生物種
全生物種
利用条件 GPL
データ更新頻度 (過去2年間) 29
最終更新日(調査日) 2014/03/17 (2014/03/20)
利用できるID
N/A
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

N/A

論文等(PubMed ID)

pmid:23329690 | pmid:23023983 | pmid:20427515 | pmid:19378139 | pmid:18439255 | pmid:18372315 | pmid:17118958 | pmid:15661851 | pmid:12136088 | pmid:23329690