成果物名 | Recount |
成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | 次世代シーケンサーの誤読による配列度数誤差を修正するプログラムです。(オリジナルサイトから翻訳) |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | - |
インターフェイス | CUI |
入力 | |
出力 | |
入力例 | Perlで記述されたラッパープログラムを起動してRecountを実行させるには次の様に入力する:perl recount.pl <input><no_of_neighbor_mismatch> |
キーワード | Probabilistic Error Correction |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 0.118|http://seq.cbrc.jp/recount/archive/ |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | DNA-配列 次世代シーケンサーデータ |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | GPL |
データ更新頻度 (過去2年間) | 2回/1年 |
最終更新日(調査日) | 2010/09/24 (2019/06/03) |
利用できるID | N/A |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | N/A |
論文等(PubMed ID) | pmid:20180274 |
稼働状況 | 運用終了 |