ツール

Recount

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成果物名Recount
成果物の別名なし
成果物に関する説明次世代シーケンサーの誤読による配列度数誤差を修正するプログラムです。(オリジナルサイトから翻訳)
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURL-
インターフェイスCUI
入力
出力
入力例Perlで記述されたラッパープログラムを起動してRecountを実行させるには次の様に入力する:perl recount.pl <input><no_of_neighbor_mismatch>
キーワードProbabilistic Error Correction
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法0.118|http://seq.cbrc.jp/recount/archive/
使っている外部リソースなし
主な対象データDNA-配列  次世代シーケンサーデータ
生物種全生物種
利用条件GPL
データ更新頻度 (過去2年間)2回/1年
最終更新日(調査日)2010/09/24 (2019/06/03)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクN/A
論文等(PubMed ID)pmid:20180274
稼働状況運用終了