成果物名 | SpiceHIT |
成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | CE-MSによるSIM分析データから、化合物ピークを迅速に同定するためのJavaソフトウェア。CSVテキストファイルを読み込んで、ピーク幅やピーク強度の閾値、スムージング機能などを用いてピーク抽出を行うことができる。あらかじめ用意した定義ファイルに基づいて、ピークの化合物名のアノテーションを自動で行うことができる。また、定義ファイルにはない溶出時間の異なる未知ピークに関しても一括してデータを収集することができ、GUIの画面でそれらのアノテーションをつけることもできる。同定したピークについて、質量値ごとにシートに分かれたExcel形式のレポートファイルを出力できる。同じ質量値の未知ピークを統一的に扱うことで、大規模なメタボローム解析用のデータセットを作成することができる。 |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | かずさDNA研究所 |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | http://www.kazusa.or.jp/komics/ja/tool-ja/13-spicehit.html |
インターフェイス | GUIツール |
入力 | |
出力 | |
入力例 | method fileとraw dataを読み込んで、Analyzeボタンを押すと結果が表示される。その後Fileメニューからレポートファイルをセーブできる。 |
キーワード | 選択的イオンモニター法 | peak identification tool|capillary electrophoresis|mass spectrometory |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 13.4|http://www.kazusa.or.jp/komics/images/komics/tool/SpiceHit/SpiceHit_2.1.zipをダウンロード |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | 代謝産物 |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | 本ソフトウェアはアカデミックフリーです。商用利用は認めておりません。 |
データ更新頻度 (過去2年間) | 0-1回/年 |
最終更新日(調査日) | 2013/05/22 (2019/07/09) |
利用できるID | N/A |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | N/A |
論文等(PubMed ID) | pmid:12855464 | pmid:16204111 |
稼働状況 | 公開中 |