| 成果物名 | SpiceHIT |
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | CE-MSによるSIM分析データから、化合物ピークを迅速に同定するためのJavaソフトウェア。CSVテキストファイルを読み込んで、ピーク幅やピーク強度の閾値、スムージング機能などを用いてピーク抽出を行うことができる。あらかじめ用意した定義ファイルに基づいて、ピークの化合物名のアノテーションを自動で行うことができる。また、定義ファイルにはない溶出時間の異なる未知ピークに関しても一括してデータを収集することができ、GUIの画面でそれらのアノテーションをつけることもできる。同定したピークについて、質量値ごとにシートに分かれたExcel形式のレポートファイルを出力できる。同じ質量値の未知ピークを統一的に扱うことで、大規模なメタボローム解析用のデータセットを作成することができる。 |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | かずさDNA研究所 |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://www.kazusa.or.jp/komics/ja/tool-ja/13-spicehit.html |
| インターフェイス | GUIツール |
| 入力 | |
| 出力 | |
| 入力例 | method fileとraw dataを読み込んで、Analyzeボタンを押すと結果が表示される。その後Fileメニューからレポートファイルをセーブできる。 |
| キーワード | 選択的イオンモニター法 | peak identification tool|capillary electrophoresis|mass spectrometory |
| ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 13.4|http://www.kazusa.or.jp/komics/images/komics/tool/SpiceHit/SpiceHit_2.1.zipをダウンロード |
| 使っている外部リソース | なし |
| 主な対象データ | 代謝産物 |
| 生物種 | 全生物種 |
| 利用条件 | 本ソフトウェアはアカデミックフリーです。商用利用は認めておりません。 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 0-1回/年 |
| 最終更新日(調査日) | 2013/05/22 (2019/07/09) |
| 利用できるID | N/A |
| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
| 外部リンク | N/A |
| 論文等(PubMed ID) | pmid:12855464 | pmid:16204111 |
| 稼働状況 | 公開中 |