成果物名 CentroidAlign
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

CentroidAlignは、sum-of-pairスコア最大化法を利用して、精度よく、高速にRNAの多重アラインメントを作成します。ダウンロードページから3種のアーカイブ(linux(Intel用)、linux(AMD用)、windows)を取得できます。(オリジナルサイトから翻訳)

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL -
インターフェイス CUI
入力

出力

入力例

RNA多重アラインメントを作成するには次の様に入力する。centroid_align [options] seq-file(fasta format)

キーワード
SPS | 多重RNA配列
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 なし
使っている外部リソース なし
主な対象データ RNA アラインメント
生物種
全生物種
利用条件 複数のソフトを利用しているため、ダウンロードファイルに含まれているLicense.txtを確認してください。
データ更新頻度 (過去2年間) 1回/年
最終更新日(調査日) 2010/01/01 (2011/01/12)
利用できるID
N/A
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

N/A

論文等(PubMed ID)

pmid:19808876