ツール

CentroidAlign

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成果物名CentroidAlign
成果物の別名なし
成果物に関する説明CentroidAlignは、sum-of-pairスコア最大化法を利用して、精度よく、高速にRNAの多重アラインメントを作成します。ダウンロードページから3種のアーカイブ(linux(Intel用)、linux(AMD用)、windows)を取得できます。(オリジナルサイトから翻訳)
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURL-
インターフェイスCUI
入力
出力
入力例RNA多重アラインメントを作成するには次の様に入力する。centroid_align [options] seq-file(fasta format)
キーワードSPS | 多重RNA配列
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法なし
使っている外部リソースなし
主な対象データRNA アラインメント
生物種全生物種
利用条件複数のソフトを利用しているため、ダウンロードファイルに含まれているLicense.txtを確認してください。
データ更新頻度 (過去2年間)1回/年
最終更新日(調査日)2010/01/01 (2019/07/05)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクN/A
論文等(PubMed ID)pmid:19808876
稼働状況運用終了