成果物名 | CentroidAlign |
成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | CentroidAlignは、sum-of-pairスコア最大化法を利用して、精度よく、高速にRNAの多重アラインメントを作成します。ダウンロードページから3種のアーカイブ(linux(Intel用)、linux(AMD用)、windows)を取得できます。(オリジナルサイトから翻訳) |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | - |
インターフェイス | CUI |
入力 | |
出力 | |
入力例 | RNA多重アラインメントを作成するには次の様に入力する。centroid_align [options] seq-file(fasta format) |
キーワード | SPS | 多重RNA配列 |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | なし |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | RNA アラインメント |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | 複数のソフトを利用しているため、ダウンロードファイルに含まれているLicense.txtを確認してください。 |
データ更新頻度 (過去2年間) | 1回/年 |
最終更新日(調査日) | 2010/01/01 (2019/07/05) |
利用できるID | N/A |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | N/A |
論文等(PubMed ID) | pmid:19808876 |
稼働状況 | 運用終了 |