ツール

ChIP2LAMP

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成果物名ChIP2LAMP
成果物の別名Convert ChIP-seq and RNA-seq results to input files of LAMP
成果物に関する説明「ChIP2LAMP」は、ChIP-seqとRNA-seq結果を統合し、発現変動に有意に関連する転写因子の組合せを見つけるソフトウェアです。
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
機関所在国日本
サイトURLhttp://seselab.org/chip2lamp/
インターフェイスCUI
入力遺伝子位置(BEDフォーマット)
出力遺伝子位置の統計データ(テキスト)
入力例サイト画面にて3個の例(test_dist.txt, test_exp.txt, test_peak.txt)を用いて、動かし方と結果が示されている。
キーワード
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法8.2M|http://seselab.org/chip2lamp/chip2lamp-1.0.zip
使っている外部リソースなし
主な対象データDNA-配列 , RNA-配列
生物種全生物種
利用条件なし
データ更新頻度 (過去2年間)不明
最終更新日(調査日)2015/06/27 (2019/06/03)
利用できるIDなし
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクなし
論文等(PubMed ID)
稼働状況公開中