成果物名 | ChIP2LAMP |
成果物の別名 | Convert ChIP-seq and RNA-seq results to input files of LAMP |
成果物に関する説明 | 「ChIP2LAMP」は、ChIP-seqとRNA-seq結果を統合し、発現変動に有意に関連する転写因子の組合せを見つけるソフトウェアです。 |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門 |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | http://seselab.org/chip2lamp/ |
インターフェイス | CUI |
入力 | 遺伝子位置(BEDフォーマット) |
出力 | 遺伝子位置の統計データ(テキスト) |
入力例 | サイト画面にて3個の例(test_dist.txt, test_exp.txt, test_peak.txt)を用いて、動かし方と結果が示されている。 |
キーワード | |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 8.2M|http://seselab.org/chip2lamp/chip2lamp-1.0.zip |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | DNA-配列 , RNA-配列 |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | なし |
データ更新頻度 (過去2年間) | 不明 |
最終更新日(調査日) | 2015/06/27 (2019/06/03) |
利用できるID | なし |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | なし |
論文等(PubMed ID) | |
稼働状況 | 公開中 |