成果物名 ChIP2LAMP
成果物の別名 Convert ChIP-seq and RNA-seq results to input files of LAMP
成果物に関する説明

「ChIP2LAMP」は、ChIP-seqとRNA-seq結果を統合し、発現変動に有意に関連する転写因子の組合せを見つけるソフトウェアです。

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
機関所在国 日本
サイトURL http://seselab.org/chip2lamp/
インターフェイス CUI
入力

遺伝子位置(BEDフォーマット)

出力

遺伝子位置の統計データ(テキスト)

入力例

"サイト画面にて3個の例(test_dist.txt, test_exp.txt, test_peak.txt)を用いて、動かし方と結果が示されている。"

キーワード
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 8.2M|http://seselab.org/chip2lamp/chip2lamp-1.0.zip
使っている外部リソース 不明
主な対象データ "DNA-配列 , RNA-配列"
生物種
全生物種
利用条件 なし
データ更新頻度 (過去2年間) 不明
最終更新日(調査日) 2015/6/27
利用できるID
なし
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

なし

論文等(PubMed ID)