ツール

COSMOS

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成果物名COSMOS
成果物の別名Somatic Large Structural Variation Detector
成果物に関する説明COSMOSは全ゲノムのショートリード・シーケンスから体細胞の構造の多様性を検出することができる。また、同種のトリオから新規の構造の違いを検出するのにも適用できる。
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門
機関所在国日本
サイトURLhttp://seselab.org/cosmos/
インターフェイスCUI
入力染色体位置(BAMフォーマット)
出力染色体位置の統計データ(テキスト)
入力例簡単な入力例。%bash cosmos.sh cosmos_example/tumor.bam cosmos_example/normal.bam
キーワード体細胞構造変動
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法15.9|http://seselab.org/cosmos/cosmos.zip
使っている外部リソースなし
主な対象データ遺伝子
生物種全生物種
利用条件なし
データ更新頻度 (過去2年間)不明
最終更新日(調査日)2016/00/00 (2019/07/09)
利用できるIDなし
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクなし
論文等(PubMed ID)
稼働状況公開中