成果物名 | COSMOS |
成果物の別名 | Somatic Large Structural Variation Detector |
成果物に関する説明 | COSMOSは全ゲノムのショートリード・シーケンスから体細胞の構造の多様性を検出することができる。また、同種のトリオから新規の構造の違いを検出するのにも適用できる。 |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門 |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | http://seselab.org/cosmos/ |
インターフェイス | CUI |
入力 | 染色体位置(BAMフォーマット) |
出力 | 染色体位置の統計データ(テキスト) |
入力例 | 簡単な入力例。%bash cosmos.sh cosmos_example/tumor.bam cosmos_example/normal.bam |
キーワード | 体細胞構造変動 |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 15.9|http://seselab.org/cosmos/cosmos.zip |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | 遺伝子 |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | なし |
データ更新頻度 (過去2年間) | 不明 |
最終更新日(調査日) | 2016/00/00 (2019/07/09) |
利用できるID | なし |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | なし |
論文等(PubMed ID) | |
稼働状況 | 公開中 |