| 成果物名 | HomeoRoq |
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| 成果物の別名 | Homeolog expression analysis softwares |
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| 成果物に関する説明 | HomeoRoqはA. halleri subsp. gemmiferaとA. lyrata subsp. petraeaのゲノム配列を読み込み、異質多倍数体におけるホモログの発現のレベルを評価できる。これらのホモログ固有の発現の違いの統計的有意性を検出する。 |
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| 成果物のタイプ | Tool |
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| 運用機関 | 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門 |
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| 機関所在国 | 日本 |
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| サイトURL | http://seselab.org/homeoroq/ |
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| インターフェイス | CUI |
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| 入力 | 塩基配列(FASTAフォーマット) |
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| 出力 | 統計解析結果（テキスト） |
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| 入力例 | 親配列からインデックスファイルを作成する例。$ star --runMode genomeGenerate --genomeDir [Parent 1 dir] --genomeFastaFiles [Parent1_genome.fas] --runThreadN [Arbitrary value] --limitGenomeGenerateRAM [Arbitrary value] |
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| キーワード | ホメオログ |
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| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 10.5|http://seselab.org/homeoroq/homeoroq_140811.zip |
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| 使っている外部リソース | なし |
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| 主な対象データ | タンパク質-アミノ酸配列 |
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| 生物種 | 全生物種 |
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| 利用条件 | なし |
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| データ更新頻度 (過去2年間) | 不明 |
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| 最終更新日（調査日） | 2014/08/11 (2019/07/09) |
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| 利用できるID | なし |
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| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
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| 外部リンク | なし |
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| 論文等（PubMed ID） | PMID:24423873 |
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| 稼働状況 | 公開中 |
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