成果物名 | LAMP |
成果物の別名 | Limitless-Arity Multiple-testing Procedure |
成果物に関する説明 | 多重仮説検定を行うプログラム。転写因子と遺伝子の関係を多数与えると統計的優位な関係をリストアップする。ボンフェローニ補正と同等なファミリーワイズエラー率の補正を与え、ボンフェローに補正よりいくつかの利点がある。 |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門 |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | http://a-terada.github.io/lamp/ |
インターフェイス | CUI |
入力 | アイテム、値(テキスト(CSV)) |
出力 | 統計解析結果(テキスト) |
入力例 | サイトに3つの例(Mann-Whitney U-test, Fisher’s Exact Test, Analysis example of Human breast cancer dataset)を掲示している。 |
キーワード | |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 216|https://github.com/a-terada/lamp/archive/2.0.3.tar.gz |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | 多重検定による統計的有意性 |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | BSD |
データ更新頻度 (過去2年間) | 不明 |
最終更新日(調査日) | 2015/06/28 (2019/06/03) |
利用できるID | なし |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | なし |
論文等(PubMed ID) | PMID:23882073 |
稼働状況 | 公開中 |