成果物名 CoCoozo
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

CoCoozoはペプチド・タンデム質量分析向け並列高速サーチエンジンです。ピーク強度のパターンに相当するタンパク質配列を同定するために、MSスペクトルデータをクエリーとしてタンパク質配列データベースに対して高速な検索を行います。

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL 運用終了
インターフェイス GUI
入力

出力

入力例

左部 "Search" タブより検索画面へ移動。入力ファイル(3種類のフォーマット)を指定し、パラメータを設定して"Submit"ボタンにより検索実行。

キーワード
タンパク質
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 0|なし
使っている外部リソース SwissProt | RefSeq
主な対象データ タンパク質-配列
生物種
全生物種
利用条件 表示-改変禁止
データ更新頻度 (過去2年間) -
最終更新日(調査日) 2011/04/18 (2012/07/26)
利用できるID
UniProt Accession Number | RefSeq ID
IDを使った成果物の利用方法 -
外部リンク

なし

論文等(PubMed ID)

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