| 成果物名 | DB-SPIRE |
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| 成果物の別名 | Database for Structure-based Protein Interaction Research |
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| 成果物に関する説明 | 実験的または配列解析（ホモロジーサーチとマルチプルアライメント）によって同定されたアミノ酸配列モチーフのタンパク質立体構造における位置を登録したものです。アミノ酸配列モチーフデータベースとして、PROSITEとBLOCKSの2種類を用いました。前者は実験的のみ、後者は実験的および配列解析によるモチーフを登録したデータベースです。タンパク質立体構造データベースとしてはPDBを用い、各エントリーにおけるSEQRES行とATOM 行の両方の配列情報から、それぞれモチーフ位置を決めています。 |
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| 成果物のタイプ | DB |
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| 運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
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| 機関所在国 | 日本 |
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| サイトURL | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/dbspire/desc.html |
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| インターフェイス | GUI |
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| 入力例 | アーカイブページで検索することできる |
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| キーワード | タンパク質 |
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| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 0|なし |
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| 使っている外部リソース | PROSITE | BLOCKS | PDB | SCOP |
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| 主な対象データ | タンパク質-モチーフ |
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| 生物種 | 全生物種 |
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| 利用条件 | 表示-継承 |
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| データ更新頻度 (過去2年間) | 0 |
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| 最終更新日（調査日） | 2017/02/16 (2019/07/02) 運用終了、アーカイブ化 |
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| 利用できるID | PDP ID | PROSITE AC | BLOCKS AC |
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| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
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| 外部リンク | なし |
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| 論文等（PubMed ID） | なし |
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| 稼働状況 | アーカイブ化 |
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