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myPresto

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成果物名myPresto
成果物の別名なし
成果物に関する説明myPrestoは、国等から委託を受けて実施した「生体高分子立体構造情報解析」等のプロジェクトの中で開発した分子シミュレーションを構成するプログラム群等です。 myPrestoは、医薬品開発支援のために作成された分子シミュレーション計算のプログラム群であり、化合物の二次元構造を三次元構造に変換し、タンパク質等のモデリング、タンパク質-薬物ドッキング、in silicoスクリーニング等を従来に比べて短時間で高精度・高能率に行うことができます。
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://presto.protein.osaka-u.ac.jp/myPresto4/index.html
インターフェイスGUI
入力
出力
入力例パスを設定していない場合の実行方法の例。% ../bin/sievgene < control
キーワード分子シミュレーション計算
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法-
使っている外部リソースKEGG
主な対象データタンパク質-立体構造
生物種全生物種
利用条件表示-継承登録必要
データ更新頻度 (過去2年間)3回/1年
最終更新日(調査日)2019/04/22 (2019/07/09)
利用できるID-
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクKEGG (http://www.genome.jp/kegg/drug/)
論文等(PubMed ID)The filling potential method: A method for estimating the free energy surface for protein-ligand docking", Yoshifumi Fukunishi, Yoshiaki Mikami, and Haruki Nakamura, J. Phys. Chem. B. (2003) 107, 13201-13210.
稼働状況公開中