成果物名 | myPresto |
成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | myPrestoは、国等から委託を受けて実施した「生体高分子立体構造情報解析」等のプロジェクトの中で開発した分子シミュレーションを構成するプログラム群等です。 myPrestoは、医薬品開発支援のために作成された分子シミュレーション計算のプログラム群であり、化合物の二次元構造を三次元構造に変換し、タンパク質等のモデリング、タンパク質-薬物ドッキング、in silicoスクリーニング等を従来に比べて短時間で高精度・高能率に行うことができます。 |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | http://presto.protein.osaka-u.ac.jp/myPresto4/index.html |
インターフェイス | GUI |
入力 | |
出力 | |
入力例 | パスを設定していない場合の実行方法の例。% ../bin/sievgene < control |
キーワード | 分子シミュレーション計算 |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | - |
使っている外部リソース | KEGG |
主な対象データ | タンパク質-立体構造 |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | 表示-継承登録必要 |
データ更新頻度 (過去2年間) | 3回/1年 |
最終更新日(調査日) | 2019/04/22 (2019/07/09) |
利用できるID | - |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | KEGG (http://www.genome.jp/kegg/drug/) |
論文等(PubMed ID) | The filling potential method: A method for estimating the free energy surface for protein-ligand docking", Yoshifumi Fukunishi, Yoshiaki Mikami, and Haruki Nakamura, J. Phys. Chem. B. (2003) 107, 13201-13210. |
稼働状況 | 公開中 |