成果物名 | POODLE |
成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | POODLEは、アミノ酸配列から機械学習法を用いて、タンパク質のディスオーダー(立体構造を形成しない)領域を予測するプログラム群です。POODLEは、短いディスオーダー領域用(S)、長いディスオーダー領域用(L)と配列全体用(W)の3種類があります。 |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | http://togo.medals.jp/semantic.html#2 |
インターフェイス | GUI | Webサービス(SOAP) |
入力 | |
出力 | |
入力例 | 1.プログラムを選択する。2.アミノ酸配列をテキストボックスに入力する。(3.)SかWを選択した場合は、E-mailアドレスを入力する。4."submit"をクリックする。 |
キーワード | 蛋白質 | ディスオーダー | 予測 |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | -|なし |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | タンパク質-アミノ酸特性 |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | 表示 - 非営利 |
データ更新頻度 (過去2年間) | 1 |
最終更新日(調査日) | 2007/05/06 (2019/07/09) |
利用できるID | なし |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | なし |
論文等(PubMed ID) | pmid:17599940 | pmid:17545177 | pmid:17338828 |
稼働状況 | 公開中 |