成果物名 WoLF PSORT
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

WoLF PSORTは1) アミノ酸から蛋白質の細胞内局在予測2) 蛋白質の細胞内局在化アノテーションを提供しています。1)は任意のアミノ酸配列に対してできる。2)はuniprotと文献情報を整理した情報です。

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://togo.medals.jp/semantic.html#2
インターフェイス Web | Web service(SOAP)
入力

出力

入力例

HPテキストボックスにアミノ酸配列を貼り付けるか、multifasta形式の配列データファイルをアップロードします。

キーワード
タンパク質 | 細胞内局在予測
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 12|wolfpsort.orgからリンクを追うとバージョン毎のダウンロードページに 辿り着けます。
使っている外部リソース SWISS-Prot
主な対象データ タンパク質-配列  真核生物の核ゲノムにコードされている蛋白質
生物種
真核生物
利用条件 表示-非営利-継承
データ更新頻度 (過去2年間) 1
最終更新日(調査日) 2007/08/15 (2012/07/26)
利用できるID
UniProt Accession Number
IDを使った成果物の利用方法 現在サポートされていない。
外部リンク

"Uniprot(uniprot.ort), Tair(arabidopsis.org), PubMed(ncbi.nlm.nih.gov/entrez/), Gene Ontology(www.geneontology.org)"

論文等(PubMed ID)

pmid:17517783 | pmid:17951705 | Paul Horton, Keun-Joon Park, Takeshi Obayashi & Kenta Nakai, "Protein Subcellular Localization Prediction with WoLF PSORT", Proceedings of the 4th Annual Asia Pacific Bioinformatics Conference APBC06, Taipei, Taiwan. pp. 39-48, 2006. | 「アミノ酸配列に基づくタンパク質の細胞内局在予測」, 中井謙太・Paul Horton 実験医学増刊号, 「バイオインフォマティクスツール の開発と生命研究への応用の最前線」, 羊土社, 26(7):140-6, 2008. | Paul Horton・中井謙太, 中村・礒合・石川・平川・坊農(編), "バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法 改訂第2版", 羊土社, 2007.