WoLF PSORT
| 成果物名 | WoLF PSORT |
|---|---|
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | WoLF PSORTは1) アミノ酸から蛋白質の細胞内局在予測2) 蛋白質の細胞内局在化アノテーションを提供しています。1)は任意のアミノ酸配列に対してできる。2)はuniprotと文献情報を整理した情報です。 |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://togo.medals.jp/semantic.html#2 |
| インターフェイス | Web | Web service(SOAP) |
| 入力 | |
| 出力 | |
| 入力例 | ＨＰテキストボックスにアミノ酸配列を貼り付けるか、multifasta形式の配列データファイルをアップロードします。 |
| キーワード | タンパク質 | 細胞内局在予測 |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 12|wolfpsort.orgからリンクを追うとバージョン毎のダウンロードページに 辿り着けます。 |
| 使っている外部リソース | SWISS-Prot |
| 主な対象データ | タンパク質-配列 真核生物の核ゲノムにコードされている蛋白質 |
| 生物種 | 真核生物 |
| 利用条件 | 表示-非営利-継承 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 1 |
| 最終更新日（調査日） | 2007/08/15 (2019/06/03) |
| 利用できるID | UniProt Accession Number |
| IDを使った成果物の利用方法 | 現在サポートされていない。 |
| 外部リンク | Uniprot(uniprot.ort), Tair(arabidopsis.org), PubMed(ncbi.nlm.nih.gov/entrez/), Gene Ontology(www.geneontology.org) |
| 論文等（PubMed ID） | pmid:17517783 | pmid:17951705 | Paul Horton, Keun-Joon Park, Takeshi Obayashi & Kenta Nakai, "Protein Subcellular Localization Prediction with WoLF PSORT", Proceedings of the 4th Annual Asia Pacific Bioinformatics Conference APBC06, Taipei, Taiwan. pp. 39-48, 2006. | 「アミノ酸配列に基づくタンパク質の細胞内局在予測」, 中井謙太・Paul Horton 実験医学増刊号, 「バイオインフォマティクスツール の開発と生命研究への応用の最前線」, 羊土社, 26(7):140-6, 2008. | Paul Horton・中井謙太, 中村・礒合・石川・平川・坊農(編), "バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法 改訂第２版", 羊土社, 2007. |
| 稼働状況 | 公開中 |