成果物名 | miRRim |
成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | miRRimは隠れマルコフモデル(HMM)をベースとしたmiRNA遺伝子の予測ツールです。このツールでは、miRNAの進化的、二次構造の特徴が多次元ベクトルシーケンスで表現されています。HMMsは配列の連続値を計算し、ベクトルシーケンスに利用されるモデルです。(オリジナルサイトから翻訳) |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | - |
インターフェイス | CUI(Charactor User Interface, またはコマンドライン) |
入力 | |
出力 | |
入力例 | perl ./miRRim.pl example/chr9_94011601_94111600_+.dat |
キーワード | HMMs | miRNA |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | なし |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | RNA (miRNA) |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | - |
データ更新頻度 (過去2年間) | 2 |
最終更新日(調査日) | 2010/04/23 (2019/07/08) |
利用できるID | - |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | - |
論文等(PubMed ID) | pmid:17959929 |
稼働状況 | 運用終了 |