成果物名 Rentropy
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

Rentropyは、RNAの二次構造のボルツマン分布からエントロピーや、平均エネルギー、エネルギー変化を計算するツールです(出典:オリジナルサイトより翻訳) 。

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL -
インターフェイス CUI
入力

出力

入力例

"run_rentropy.exe -outfile=rentropy_out.txt -command=compute_ent_subseq -seqfile=seqs.fa-max_span=200 -length_set=100,200(ダウンロードファイルに引数で指定しているファイルと実行方法が記載されています) "

キーワード
エントロピー|RNA二次構造|ボルツマン分布
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 なし
使っている外部リソース なし
主な対象データ RNA
生物種
全生物種
利用条件 調査中
データ更新頻度 (過去2年間) 0回/年
最終更新日(調査日) 2011/00/00 (2012/06/12)
利用できるID
N/A
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

N/A

論文等(PubMed ID)

Hisanori Kiryu and Kiyoshi Asai.R-entropy: An algorithm for computing thermodynamic entropy of RNA secondary structures.(submitted)