成果物名 BioDBScan
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

「新着データお知らせツールBioDBScan」は、利用者が興味を持っている遺伝子、タンパク質、パスウェイ、疾患、化合物、薬剤などについて、NCBI、Ensembl、DrugBankなどの世界の主要なデータベースで新たにリリースされたデータの情報をお知らせするツールです。「リンク自動管理システム」の全データベース検索によって前週月曜日以降に新たにリンクされたデータが検出されると、その情報が毎週月曜日に電子メールで配信されます。BioDBScanは、新規関連文献お知らせツールPubMedScanの新機能として、平成23年度「経済産業省ライフサイエンスデータベースプロジェクト」で開発されました。産業技術総合研究所バイオメディシナル情報研究センターにて運営されています。

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
機関所在国 日本
サイトURL 運用終了
インターフェイス GUI
入力

出力

入力例

PubMedScanにユーザー名、Emailアドレスを登録。BioDBScanの画面に移動し、興味のある分子情報を登録。登録されたIDに関する新着データは毎週月曜日に自動で配信される。

キーワード
リコメンデーション | コンテンツベースフィルタリング
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 0|なし
使っている外部リソース リンク自動管理システム
主な対象データ 遺伝子、パスウェイ、疾患など
生物種
ヒト、マウス、ラット、ホヤ
利用条件 GPL
データ更新頻度 (過去2年間) 52回/年
最終更新日(調査日) 2013/01/29 (2013/01/31)
利用できるID
Accession Number | CIPRO ID | Clone ID (NBRC) | DGV ID | DrugBank ID | Ensembl Gene ID | Ensembl Protein ID | Ensembl Transcript ID | FLJ ID (NBRC) | GeneID | H-GOLD Marker ID | H-Inv cluster ID (HIX) | H-Inv protein ID (HIP) | H-Inv transcript ID (HIT) | HPRD ID | HUGO gene symbol | KEGG Gene ID | KEGG Pathway ID | OMIM ID | PDB ID | PdbeChem ID | Peptide Accession | PubMed ID | RefSeq ID | RefSeq Protein ID | UniProt Accession Number | dbSNP rs# (GemDBJ) | fRNAdb ID | ALLELE ID | BRC ID | Clone ID(FANTOM) | MGI Marker Accession ID | Mouse Gene Symbol RGD ID | CAS ID | ChEBI ID | DrugBank ID | HMDB Accession Number | KEGG Compound ID | KEGG Drug ID | KNApSAcK ID | NIKKAJI ID | PDBeChem ID | PharmGKB ID | PubChem Compound ID | PubChem Substance ID
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

Hyperlink Management System (http://biodb.jp/)

論文等(PubMed ID)

なし