ツール

CADLIVE

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成果物名CADLIVE
成果物の別名Computer-Aided Design of LIVing systEms
成果物に関する説明CADLIVE とは、生命ネットワーク(代謝、遺伝子発現ネットワーク)解明のために、GUIを用いてネットワークを構築し、シミュレータと連携可能な形式でデータベースに保存することができるシステムです。複雑な分子間相互作用をもつ生命ネットワークを化学反応式によって記述することができます。本システムはGUIネットワークコンストラクター、仮想ノックアウト変異に対するパスウェイ検索プログラム、グリッドレイアウトプログラム、代謝制御ツールから構成されています。ネットワークコンストラクターは大規模代謝ネットワークマップを作成できます。仮想ノックアウト変異様のパスウェイサーチプログラムは2生物間の全ての可能性を探索するため、ノックアウト変異に対しては応用できます。グリッドレイアウトプログラムは生化学ネットワークマップを2次元グリッド上に自動投射します。ダイナミックシミュレーターは、生化学ネットワークマップを動的モデルに変換し、それらダイナミクスをシミュレートします。代謝制御ツールは要素モードをベースとしたアルゴリズムで開発されました。本システム開発の一部はNEDOプロジェクトからの財政的サポートで実施されました。(オリジナルサイトから)
成果物のタイプTool
運用機関九州工業大学
機関所在国日本
サイトURLhttp://www.cadlive.jp/
インターフェイスGUI
入力
出力
入力例不明
キーワード代謝制御 | パスウェイ | シミュレーター | 要素モード分析
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法12.2|ソフトウェアは無料ダウンロード可能 http://kurata21.bio.kyutech.ac.jp/cadlive/editor/download.html
使っている外部リソースなし
主な対象データ代謝産物
生物種全生物種
利用条件なし
データ更新頻度 (過去2年間)0
最終更新日(調査日)2011/05/23 (2019/07/09)
利用できるIDなし
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクなし
論文等(PubMed ID)pmid:17940089 | pmid:15805500 | pmid:15677705 | pmid:12853624
稼働状況公開中