| 成果物名 | KATANA |
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| 成果物の別名 | シロイヌナズナ遺伝子情報データベース |
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| 成果物に関する説明 | シロイヌナズナのゲノム情報を様々な公共データベースから取得することができます。多くのデータベース間での変化は、同じ遺伝子を別の注釈を付けることができます。命名規則を鑑み、我々はWebベースのツールKATANA（かずさシロイヌナズナアノテーション抄録; http://www.kazusa.or.jp/katana/）を開発し、ユーザーがシロイヌナズナのゲノム情報に関連する公共のデータベースに1つのサイトからの検索できるように誘導します。（出典：論文より）このツールには、遺伝子とタンパク質、遺伝子ファミリー、遺伝子オントロジー（GO）ターム、Massively Parallel Signature Sequencing法（MPSS）の実験から得られた代謝経路や遺伝子発現データの情報とアノテーションが含まれます。このツール内のエントリにはそれらのデータベースへのハイパーリンクがあり、元のサイトにアクセスすることで詳細化できます。代謝経路とGOタームの高度な検索も行うことができます。（出典：オリジナルペーパーより） |
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| 成果物のタイプ | DB |
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| 運用機関 | かずさDNA研究所 |
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| 機関所在国 | 日本 |
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| サイトURL | http://www.kazusa.or.jp/katana/index.html |
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| インターフェイス | GUI |
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| 入力例 | ANNOME; Search for Information of Arabidopsis Genes from Annotation Keywords or AGI-Codesのページにアクセスした後、キーワードでアノテーションの情報を検索することができる |
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| キーワード | シロイヌナズナ | データベース | アノテーション | 遺伝子オントロジー | 代謝経路 |
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| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 0|なし |
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| 使っている外部リソース | TAIR | TIGR | KEGG | AtTFDB | MIPS | AraCyc |
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| 主な対象データ | 遺伝子発現 、代謝経路、GO |
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| 生物種 | Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ] |
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| 利用条件 | なし |
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| データ更新頻度 (過去2年間) | 2年以上なし |
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| 最終更新日（調査日） | 2007/02/19 (2019/07/03) |
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| 利用できるID | N/A |
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| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
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| 外部リンク | TAIR | TIGR | MIPS| KEGG | AraCyc | agris | MPSS | GO |
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| 論文等（PubMed ID） | KATANA: A web-based guide to public databases for Arabidopsis genomic information Kentaro Yano, Tomoko Dansako, Nozomu Sakurai, Hideyuki Suzuki, Daisuke Shibata, Plant Biotechnology 22(3), 225-229 (2005). |
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| 稼働状況 | 稼働中 |
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