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CentroidHomfold
| 成果物名 | CentroidHomfold |
|---|---|
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | CentroidHomfoldは相同性配列を使ったRNAの2次構造予測を行います。ダウンロード版とWebサーバー版が提供されています。CentroidHomfoldはCentroidFoldのソフトウェアパッケージに含まれています。(オリジナルサイトから翻訳) |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://rtools.cbrc.jp/ |
| インターフェイス | CUI | GUI |
| 入力 | 塩基配列(FASTAフォーマット) |
| 出力 | RNAの2次構造(テキスト, PNG, PDF, EPSフォーマット) |
| 入力例 | centroid_homfold [options] input_seq(FASTA format) |
| キーワード | RNA二次構造 | 相同性配列 | LAST | Centroifold |
| ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | なし |
| 使っている外部リソース | なし |
| 主な対象データ | 二次構造 |
| 生物種 | 全生物種 |
| 利用条件 | GPL |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 1回以上/1年 |
| 最終更新日(調査日) | 2011/01/01 (2019/06/03) |
| 利用できるID | N/A |
| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
| 外部リンク | N/A |
| 論文等(PubMed ID) | pmid:19478007 |
| 稼働状況 | 公開中 |
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