成果物名 CentroidHomfold
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

CentroidHomfoldは相同性配列を使ったRNAの2次構造予測を行います。ダウンロード版とWebサーバー版が提供されています。CentroidHomfoldはCentroidFoldのソフトウェアパッケージに含まれています。(オリジナルサイトから翻訳)

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://rtools.cbrc.jp/
インターフェイス CUI | GUI
入力

塩基配列(FASTAフォーマット)

出力

"RNAの2次構造(テキスト, PNG, PDF, EPSフォーマット)"

入力例

centroid_homfold [options] input_seq(FASTA format)

キーワード
RNA二次構造 | 相同性配列 | LAST | Centroifold
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 なし
使っている外部リソース なし
主な対象データ 二次構造
生物種
全生物種
利用条件 GPL
データ更新頻度 (過去2年間) 1回以上/1年
最終更新日(調査日) 2011/01/01 (2011/01/12)
利用できるID
N/A
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

N/A

論文等(PubMed ID)

pmid:19478007