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TACT
| 成果物名 | TACT |
|---|---|
| 成果物の別名 | Transcriptome Auto-annotation Conducting Tool |
| 成果物に関する説明 | Transcriptome Auto-annotation Conducting Tool (TACT)は相同性検索(BLASTX, FASTY)、ORF予測、モチーフ検索解析(InterProScan)を統合し、真核生物遺伝子の機能を自動予測できる統合的自動アノテーションシステムです。TACTはH-Invitationalプロジェクトの一環として開発され、 ヒト遺伝子アノテーション統合データベースH-Invitational Database (H-InvDB)の構築・発展に貢献しています。 |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | - |
| インターフェイス | GUI |
| 入力 | |
| 出力 | |
| 入力例 | 画面上部中央のクエリー入力画面に塩基配列またはDDBJ accessionを入力して、「クエリ送信」ボタンを押してください。 |
| キーワード | 遺伝子 |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 0.0|なし |
| 使っている外部リソース | DDBJ/EMBL/GenBank | Ensembl | Gene ontology (GO) | H-InvDB | InterPro | RefSeq | UCSC | UniProt |
| 主な対象データ | DNA-配列 |
| 生物種 | 脊椎動物-哺乳類-ヒトヒト以外の41生物種（http://h-invitational.jp/tact/species.html） |
| 利用条件 | 表示-改変禁止アカウント不要 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 9 |
| 最終更新日（調査日） | 2008/03/03 (2019/07/05) |
| 利用できるID | Transcript ID (DDBJ accession for H-InvDB transcripts) |
| IDを使った成果物の利用方法 | http://h-invitational.jp/tact/cgi-bin/tact.cgi?acc=[DDBJ accession] |
| 外部リンク | H-InvDB(http://www.h-invitational.jp/) |
| 論文等（PubMed ID） | pmid:16845023 |
| 稼働状況 | 運用終了 |
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