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H-InvDB

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成果物名H-InvDB
成果物の別名H-Invitational database
成果物に関する説明H-InvDBはヒトの遺伝子と転写産物を対象とした統合データベースです。ヒトのすべての転写産物の配列をあらゆる手法で解析することにより、ヒト遺伝子の構造、選択的スプライシング、タンパク質としての機能などの精査されたアノテーション（注釈付け）情報を提供しています。
成果物のタイプDB
運用機関産業技術総合研究所　創薬分子プロファイリング研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://www.h-invitational.jp/hinv/ahg-db/index_ja.jsp
インターフェイスGUI | FTP | SOAP web service | REST web service
入力例トップ画面の右上部にあるテキストボックスに「kinase」などのキーワードを入力し、右側にある「GO」ボタンをクリックしてください。
キーワードcDNA | アノテーション | 統合
ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法2628.656|FTP:ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/mirror_database/hinv/ またはHTTP:http://www.h-invitational.jp/hinv/dataset/download_jp.cgiからファイルダウンロード
使っている外部リソースCHGC | DKFZ/MIPS | IMSUT | KDRI | MGC/NCI | BIND | BodyMap | CCDS | dbSNP | DDBJ/EMBL/GenBank | DIP | Ensembl | EntrezGene | fRNAdb | GenAtlas | Gene ontology (GO) | GeneCards | GGDB | GTOP | HGNC | H-GOLD (GDBS) | HPRD | IntAct | InterPro | KEGG | LIFEdb | LSBM | MGI | MINT | Mutation view | NC-IUBMB (EC) | OMIM | PubMed | RefSeq | UCSC | UniGene | UniProt
主な対象データRNA ヒト完全長cDNA, mRNA
生物種Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
利用条件表示-継承アカウント不要
データ更新頻度 (過去2年間)6
最終更新日（調査日）2015/06/23 (2019/07/04)
利用できるIDH-Inv cluster ID (HIX) | H-Inv transcript ID (HIT) | H-Inv protein ID (HIP) | H-Inv family ID (HIF)
IDを使った成果物の利用方法http://www.h-invitational.jp/hinv/spsoup/locus_view?hix_id=[HIX]
外部リンクCHGC (http://www.chgc.sh.cn/en/) | DKFZ/MIPS (http://www.dkfz.de/) | IMSUT (http://www.ims.u-tokyo.ac.jp/imsut/en/) | KDRI (http://www.kazusa.or.jp/e/) | MGC/NCI (http://mgc.nci.nih.gov/) | BIND (http://bond.unleashedinformatics.com/) | BodyMap (http://bodymap.ims.u-tokyo.ac.jp/) | CCDS (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/CCDS/CcdsBrowse.cgi?REQUEST=CCDS&DATA=CCDS4091) | dbSNP (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snp_ref.cgi?searchType=adhoc_search&type=rs&rs=rs35752268) | DDBJ (http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/search/get_entry?accnumber=BC053657) | DIP (http://dip.doe-mbi.ucla.edu) | Ensembl (http://uswest.ensembl.org/Homo_sapiens/Transcript/Summary?g=ENSG00000113532;r=5:100145357-100238970;t=ENST00000231461) | EntrezGene (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Retrieve&dopt=Graphics&list_uids=7903) | fRNAdb (http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/frnadb_summary) | GenAtlas | Gene ontology (GO) (http://www.ebi.ac.uk/QuickGO/GTerm?id=GO:0008373) | GeneCards (http://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=ST8SIA4) | GGDB (http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ggdb/Homolog?cat=symbol&symbol=ST8SIA4) | GTOP (http://sybock.genes.nig.ac.jp/~hinv7/cgi-bin/mas.pl.cgi?org=hinv7&id=HIT000044689) | HGNC (http://www.genenames.org/data/hgnc_data.php?match=ST8SIA4) | H-GOLD (GDBS) (http://hinv.jp/gdbs/viewer/Viewer?ch=5&fr=100145359&to=100238970&gv=new&md=1) | HGPD (http://riodb.ibase.aist.go.jp/hgpd/cgi-bin/pg_locus_list.cgi?txt_srch_cdna_name=FLJ82330) | HPRD (http://www.hprd.org/) | IntAct (http://www.ebi.ac.uk/intact/main.xhtml) | InterPro (http://www.ebi.ac.uk/interpro/IEntry?ac=IPR012163) | KEGG (http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?hsa+7903) | LIFEdb (http://www.lifedb.de/lifedb/) | MGI (http://www.informatics.jax.org/searchtool/Search.do?query=mgi:106018) | MINT (http://mint.bio.uniroma2.it/mint/Welcome.do) | Mutation view (http://mutview.dmb.med.keio.ac.jp/MutationView/jsp/mutview/java/geneWin.jsp?omimId=) | NC-IUBMB (EC) | OMIM (http://omim.org/entry/601888) | PubMed (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/7624364?dopt=Abstract) | RefSeq (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/NM_175052) | UCSC (http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&position=chr5:100142639-100238987&db=) | UniGene (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=unigene) | UniProt (http://www.uniprot.org/uniprot/Q92187)
論文等（PubMed ID）pmid:23245335 | pmid:23197657 | pmid:19933760 | pmid:18089548 | pmid:15103394 | 山崎 千里、今西 規：ヒト遺伝子アノテーションの統合データベース ゲノム医学, 14(4), 83-90, 2004-8
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