ツール

PSTAG

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成果物名PSTAG
成果物の別名なし
成果物に関する説明PSTAGはRNAの偽結び目構造をアラインメント及び予測することができます。PSTAGアルゴリズムをベースとしたプログラムは、RNAの偽結び目構造や、さらにはncRNAの比較解析に、初めてグラマベースの実質的に実行可能なソフトウェアである。(オリジナルサイトから翻訳)
成果物のタイプTool
運用機関慶應義塾大学 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://pstag.dna.bio.keio.ac.jp/
インターフェイスGUI
入力
出力
入力例検索ページ画面(http://pstag.dna.bio.keio.ac.jp/search.html)上部の[Example]ボタンを押しし、その後[Submit]ボタンを押す
キーワードhidden Markov models | unfolded RNA sequence | secondary structure
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法0.52|http://pstag.dna.bio.keio.ac.jp/download.htmlからpstag2_1_4a-src.tar.bz2をダウンロード
使っている外部リソースなし
主な対象データRNA
生物種全生物種
利用条件なし
データ更新頻度 (過去2年間)0回
最終更新日(調査日)2004/12/10 (2019/06/03)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクなし
論文等(PubMed ID)pmid:15784748
稼働状況公開中