成果物名 | PSTAG |
成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | PSTAGはRNAの偽結び目構造をアラインメント及び予測することができます。PSTAGアルゴリズムをベースとしたプログラムは、RNAの偽結び目構造や、さらにはncRNAの比較解析に、初めてグラマベースの実質的に実行可能なソフトウェアである。(オリジナルサイトから翻訳) |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 慶應義塾大学 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | http://pstag.dna.bio.keio.ac.jp/ |
インターフェイス | GUI |
入力 | |
出力 | |
入力例 | 検索ページ画面(http://pstag.dna.bio.keio.ac.jp/search.html)上部の[Example]ボタンを押しし、その後[Submit]ボタンを押す |
キーワード | hidden Markov models | unfolded RNA sequence | secondary structure |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 0.52|http://pstag.dna.bio.keio.ac.jp/download.htmlからpstag2_1_4a-src.tar.bz2をダウンロード |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | RNA |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | なし |
データ更新頻度 (過去2年間) | 0回 |
最終更新日(調査日) | 2004/12/10 (2019/06/03) |
利用できるID | N/A |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | なし |
論文等(PubMed ID) | pmid:15784748 |
稼働状況 | 公開中 |