ツール

Stem Kernels

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成果物名Stem Kernels
成果物の別名なし
成果物に関する説明StemKernelsは二次構造の観点から、RNAペア間の相同性を計測する為の、構造RNA用カーネル関数を実装したツールです。(オリジナルサイトから翻訳)
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURL-
インターフェイスCUI
入力
出力
入力例stem_kernel_lite -n pre-computed-kernel-matrix +1 input_positive_seq(FASTA format) -1 input_negative_seq(FASTA format)
キーワードカーネル関数 | RNA配列 | 有向性グラフ
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法なし
使っている外部リソースなし
主な対象データRNA
生物種全生物種
利用条件GPL
データ更新頻度 (過去2年間)なし
最終更新日(調査日)2011/03/12 (2019/07/05)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクN/A
論文等(PubMed ID)pmid:18647390 | pmid:17933013
稼働状況運用終了