成果物名 Stem Kernels
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

StemKernelsは二次構造の観点から、RNAペア間の相同性を計測する為の、構造RNA用カーネル関数を実装したツールです。(オリジナルサイトから翻訳)

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL -
インターフェイス CUI
入力

出力

入力例

stem_kernel_lite -n pre-computed-kernel-matrix +1 input_positive_seq(FASTA format) -1 input_negative_seq(FASTA format)

キーワード
カーネル関数 | RNA配列 | 有向性グラフ
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 なし
使っている外部リソース なし
主な対象データ RNA
生物種
全生物種
利用条件 GPL
データ更新頻度 (過去2年間) なし
最終更新日(調査日) 2008/09/13 (2010/11/11)
利用できるID
N/A
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

N/A

論文等(PubMed ID)

pmid:18647390 | pmid:17933013