成果物名 | Stem Kernels |
成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | StemKernelsは二次構造の観点から、RNAペア間の相同性を計測する為の、構造RNA用カーネル関数を実装したツールです。(オリジナルサイトから翻訳) |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | - |
インターフェイス | CUI |
入力 | |
出力 | |
入力例 | stem_kernel_lite -n pre-computed-kernel-matrix +1 input_positive_seq(FASTA format) -1 input_negative_seq(FASTA format) |
キーワード | カーネル関数 | RNA配列 | 有向性グラフ |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | なし |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | RNA |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | GPL |
データ更新頻度 (過去2年間) | なし |
最終更新日(調査日) | 2011/03/12 (2019/07/05) |
利用できるID | N/A |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | N/A |
論文等(PubMed ID) | pmid:18647390 | pmid:17933013 |
稼働状況 | 運用終了 |