成果物名 SMARTS 3D
成果物の別名 立体配座コードプログラム解析
成果物に関する説明

赤外円二色性(VCD)分光法を用いたキラル医薬品の絶対配置の決定には精度の高い溶液状態の構造を把握する必要があることから、煩雑な構造解析の検証を目的として、あらゆる有機分子に適用可能な、コンフォメーションをクリック操作でコード化して記述するプログラムをpythonスクリプト言語を用いて開発しました。
2次元の化学構造式はSMARTS記法により容易に部分構造検索が行えるようになっています。さらに特許取得した相同性判定手法(特許5672596)をプログラムに組み込みSMARTS記法と組み合わせることで、異なる分子でも 3D フラグメント構造を検索することができます。

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 環境管理研究部門
機関所在国 日本
サイトURL https://staff.aist.go.jp/izumi.h/ConfCode/index.html
インターフェイス WINDOWS版プログラムをダウンロード可能
入力

タンパク質立体構造

出力

立体配座

入力例

調査中

キーワード
立体構造、立体配座、キラリティー、赤外円二色性(VCD)分光法
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 0.0|調査中
使っている外部リソース 不明
主な対象データ タンパク質配列
生物種
なし
利用条件 なし
データ更新頻度 (過去2年間) 不明
最終更新日(調査日) 2016
利用できるID
なし
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

なし

論文等(PubMed ID)

PMID:27040870