成果物名 | IPknot |
成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | RNAの特殊な2次構造である偽結び目構造(シュードノット)を期待精度最大化法で予測するツールです。(オリジナルサイトから翻訳) |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | http://rtips.dna.bio.keio.ac.jp/ipknot/ |
インターフェイス | CUI |
入力 | 塩基配列(FASTAフォーマット) |
出力 | RNAの2次構造(テキスト) |
入力例 | ipknot input_seq (FASTA format) |
キーワード | 偽結び目構造 | シュードノット |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | - (C++ source code)|https://github.com/satoken/ipknot からファイルダウンロード |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | RNA 偽結び目構造 |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | GPL |
データ更新頻度 (過去2年間) | 1回/年 |
最終更新日(調査日) | 2014/03/10 (2019/07/09) |
利用できるID | N/A |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | N/A |
論文等(PubMed ID) | なし |
稼働状況 | 公開中 |