成果物名 IPknot
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

RNAの特殊な2次構造である偽結び目構造(シュードノット)を期待精度最大化法で予測するツールです。(オリジナルサイトから翻訳)

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://rtips.dna.bio.keio.ac.jp/ipknot/
インターフェイス CUI
入力

塩基配列(FASTAフォーマット)

出力

RNAの2次構造(テキスト)

入力例

ipknot input_seq (FASTA format)

キーワード
偽結び目構造 | シュードノット
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 - (C++ source code)|https://github.com/satoken/ipknot からファイルダウンロード
使っている外部リソース なし
主な対象データ RNA 偽結び目構造
生物種
全生物種
利用条件 GPL
データ更新頻度 (過去2年間) 1回/年
最終更新日(調査日) 2010/08/04 (2011/01/12)
利用できるID
N/A
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

N/A

論文等(PubMed ID)

調査中