ツール

IPknot

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成果物名IPknot
成果物の別名なし
成果物に関する説明RNAの特殊な2次構造である偽結び目構造(シュードノット)を期待精度最大化法で予測するツールです。(オリジナルサイトから翻訳)
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://rtips.dna.bio.keio.ac.jp/ipknot/
インターフェイスCUI
入力塩基配列(FASTAフォーマット)
出力RNAの2次構造(テキスト)
入力例ipknot input_seq (FASTA format)
キーワード偽結び目構造 | シュードノット
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法- (C++ source code)|https://github.com/satoken/ipknot からファイルダウンロード
使っている外部リソースなし
主な対象データRNA 偽結び目構造
生物種全生物種
利用条件GPL
データ更新頻度 (過去2年間)1回/年
最終更新日(調査日)2014/03/10 (2019/07/09)
利用できるIDN/A
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクN/A
論文等(PubMed ID)なし
稼働状況公開中