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RactIP
| 成果物名 | RactIP |
|---|---|
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | 整数計画を使ったRNA-RNA相互作用の高速かつ精度のよい予測を行うツールです。バージョン0.0.1と0.0.2のソースコード、Windows用、Linux用が準備されています。 |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://rtips.dna.bio.keio.ac.jp/ractip/ |
| インターフェイス | CUI |
| 入力 | 塩基配列(FASTAフォーマット) |
| 出力 | 塩基の相互作用予測（テキスト） |
| 入力例 | ractip [options] input_seq1(FASTA format) input_seq2(FASTA format) |
| キーワード | 整数計画アプローチ | RNA相互作用 |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | - (C++ source code)|https://github.com/satoken/ractip からファイルダウンロード |
| 使っている外部リソース | なし |
| 主な対象データ | RNA RNA-RNA インタラクション |
| 生物種 | 全生物種 |
| 利用条件 | GPL |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 2回/1年 |
| 最終更新日（調査日） | 2014/03/10 (2019/06/03) |
| 利用できるID | N/A |
| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
| 外部リンク | N/A |
| 論文等（PubMed ID） | pmid:20823308 |
| 稼働状況 | 公開中 |
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