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ID一括変換システム
成果物名 | ID一括変換システム |
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成果物の別名 | ID Converter System |
成果物に関する説明 | ID一括変換システムは、リンク自動管理システムのデータを利用して、ヒト遺伝子とタンパク質に関係する世界の主要なデータベースのIDを相互に一括変換できるシステムです。詳細はこちらの解説を参照ください。 |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | http://biodb.jp/index.cgi?lang=jp#ids |
インターフェイス | GUI | CGI |
入力 | IDリスト(テキスト) |
出力 | IDリスト(テキスト(TSV)) |
入力例 | 変換元IDと変換先IDの種類を指定し、変換元のIDリストをテキストボックスに入力してSearchボタンを押す。変換元のIDリストはクライアントPC上のテキストファイルを指定することもできます。 |
キーワード | Gene ID |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 0.0|なし |
使っている外部リソース | DDBJ | EMBL | GenBank | H-InvDB | UniProt | PDB | HUGO |
主な対象データ | データ識別子(ID) |
生物種 | 脊椎動物-哺乳類-ヒト |
利用条件 | 表示-継承 |
データ更新頻度 (過去2年間) | 730 |
最終更新日(調査日) | 2010/09/10 (2019/07/08) |
利用できるID | Accession Number | CIPRO ID | Clone ID (NBRC) | DGV ID | DrugBank ID | Ensembl Gene ID | Ensembl Protein ID | Ensembl Transcript ID | FLJ ID (NBRC) | GeneID | H-GOLD Marker ID | H-Inv cluster ID (HIX) | H-Inv protein ID (HIP) | H-Inv transcript ID (HIT) | HPRD ID | HUGO gene symbol | KEGG Gene ID | KEGG Pathway ID | OMIM ID | PDB ID | PdbeChem ID | Peptide Accession | PubMed ID | RefSeq ID | RefSeq Protein ID | UniProt Accession Number | dbSNP rs# (GemDBJ) | fRNAdb ID | ALLELE ID | BRC ID | Clone ID(FANTOM) | MGI Marker Accession ID | Mouse Gene Symbol RGD ID | CAS ID | ChEBI ID | DrugBank ID | HMDB Accession Number | KEGG Compound ID | KEGG Drug ID | KNApSAcK ID | NIKKAJI ID | PDBeChem ID | PharmGKB ID | PubChem Compound ID | PubChem Substance ID |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | なし |
論文等(PubMed ID) | pmid:19454601 |
稼働状況 | 公開中 |
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