| 成果物名 | SlideSort |
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | 編集距離を利用してDNAやProtein配列セットから似たペアを高速に探すツールです。(オリジナルサイトから翻訳) |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://cbrc3.cbrc.jp/~shimizu/slidesort/index.php |
| インターフェイス | CUI | GUI |
| 入力 | 塩基 もしくは アミノ酸配列(FASTAフォーマット) |
| 出力 | |
| 入力例 | DNAやタンパク質配列から類似ペアを見つけるには、次にコマンドを入力する。 slidesort -i input_seq-file(fasta format) -o output_file [options] |
| キーワード | 編集距離 | レーベンシュタイン距離 |
| ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 31|http://cbrc3.cbrc.jp/~shimizu/slidesort/index.php?Downloadからファイルダウンロード |
| 使っている外部リソース | なし |
| 主な対象データ | DNA-配列 タンパク質-配列 |
| 生物種 | 全生物種 |
| 利用条件 | なし |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 3回/1年 |
| 最終更新日(調査日) | 2015/04/21 (2019/07/09) |
| 利用できるID | N/A |
| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
| 外部リンク | N/A |
| 論文等(PubMed ID) | pmid:21148542 |
| 稼働状況 | 公開中 |