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SGCAL

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成果物名SGCAL
成果物の別名Structural Glycomics Calculation
成果物に関する説明SGCALは糖鎖のグリコシド結合断片化反応に着眼し、アノマー異性体、分岐およびイオン付加位置の解析を行い、実験によりMSで得られた質量スペクトルと計算結果を統合し、スペクトルを高速に同定するため網羅的な解析システムです。
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURL-
インターフェイスGUI
入力アミノ酸配列(FASTAフォーマット)
出力切断部位予測結果(テキスト)
入力例サイトURL画面上部検索テキストボックスに”Fuc”などの単糖をKEYWORDとして入力し、[Search]ボタンを押す。
キーワード糖鎖
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法0.0|なし
使っている外部リソースなし
主な対象データ糖鎖
生物種全生物種
利用条件表示-非営利-改変禁止
データ更新頻度 (過去2年間)0
最終更新日(調査日)2006/00/00 (2019/07/08)
利用できるIDcarbohydrate ID
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクなし
論文等(PubMed ID)pmid:16442513
稼働状況運用終了