成果物名 SGCAL
成果物の別名 Structural Glycomics Calculation
成果物に関する説明

SGCALは糖鎖のグリコシド結合断片化反応に着眼し、アノマー異性体、分岐およびイオン付加位置の解析を行い、実験によりMSで得られた質量スペクトルと計算結果を統合し、スペクトルを高速に同定するため網羅的な解析システムです。

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL 運用終了
インターフェイス GUI
入力

アミノ酸配列(FASTAフォーマット)

出力

切断部位予測結果(テキスト)

入力例

サイトURL画面上部検索テキストボックスに”Fuc”などの単糖をKEYWORDとして入力し、[Search]ボタンを押す。

キーワード
糖鎖
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 2|なし
使っている外部リソース なし
主な対象データ 糖鎖
生物種
全生物種
利用条件 表示-非営利-改変禁止
データ更新頻度 (過去2年間) 0
最終更新日(調査日) 2006/00/00 (2008/10/27)
利用できるID
carbohydrate ID
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

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論文等(PubMed ID)

pmid:16442513