| 成果物名 | 機能性RNA配列データベース |
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| 成果物の別名 | fRNAdb |
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| 成果物に関する説明 | fRNAdbは、既存のRNAデータベースから収集した既知及び予測RNAの配列情報と、機能性RNAプロジェクトで採取したものや予測したRNA配列情報を提供しています。各配列には文献情報やゲノム上の位置、類似配列の情報などが関連付けられています。強力なキーワード検索と相同性検索機能を提供しています。 |
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| 成果物のタイプ | DB |
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| 運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
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| 機関所在国 | 日本 |
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| サイトURL | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/frnadb/desc.html |
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| インターフェイス | GUI |
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| 入力例 | 検索欄に"miRNA"と入力し「submit」をクリックすると、マイクロRNAとそれに関連する配列一覧が得られます。単語を追加するとより詳しい検索が可能です。例）"miRNA human"精密な検索にはディレクティブを用います。例）"miRNA[so] human[org]" |
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| キーワード | RNA | 機能性RNA |
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| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 53|Downloadメニューをクリックしてダウンロード画面からダウンロード可能です。 |
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| 使っている外部リソース | RNAdb | Rfam | Gene Expression Omnibus | miRBase | NONCODE | H-invitational | snoRNA-LBME-db | European ribosomal RNA database |
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| 主な対象データ | RNA |
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| 生物種 | 全生物種 |
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| 利用条件 | 表示-継承 |
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| データ更新頻度 (過去2年間) | 0 |
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| 最終更新日（調査日） | 2011/00/00 (2019/07/02) 運用終了、アーカイブ化 |
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| 利用できるID | FR |
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| IDを使った成果物の利用方法 | http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/frnadb_summary |
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| 外部リンク | なし |
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| 論文等（PubMed ID） | pmid:18948287 |
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| 稼働状況 | アーカイブ化 |
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