成果物名 機能性RNA配列データベース
成果物の別名 fRNAdb
成果物に関する説明

fRNAdbは、既存のRNAデータベースから収集した既知及び予測RNAの配列情報と、機能性RNAプロジェクトで採取したものや予測したRNA配列情報を提供しています。各配列には文献情報やゲノム上の位置、類似配列の情報などが関連付けられています。強力なキーワード検索と相同性検索機能を提供しています。

成果物のタイプ DB
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/frnadb_summary
インターフェイス GUI
入力例

検索欄に"miRNA"と入力し「submit」をクリックすると、マイクロRNAとそれに関連する配列一覧が得られます。単語を追加するとより詳しい検索が可能です。例)"miRNA human"精密な検索にはディレクティブを用います。例)"miRNA[so] human[org]"

キーワード
調査中
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 53|Downloadメニューをクリックしてダウンロード画面からダウンロード可能です。
使っている外部リソース RNAdb | Rfam | Gene Expression Omnibus | miRBase | NONCODE | H-invitational | snoRNA-LBME-db | European ribosomal RNA database
主な対象データ RNA
生物種
全生物種
利用条件 表示-継承
データ更新頻度 (過去2年間) 0
最終更新日(調査日) 2008/00/00 (2008/10/27)
利用できるID
FR
IDを使った成果物の利用方法 http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/frnadb_summary
外部リンク

調査中

論文等(PubMed ID)

pmid:18948287