成果物名 | seg-suite |
成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | 配列セグメントの交差や配列アラインメントの合成を行うツールです。このツールでは「seg」フォーマットを利用できます。また、様々なデータフォーマットを「seg」フォーマットに変換する事ができます。 |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | http://cbrc3.cbrc.jp/~martin/seg-suite/ |
インターフェイス | CUI |
入力 | |
出力 | |
入力例 | さまざまなデータフォーマットから、セグメントやアラインメントを作成する例:seg-import maf myAlignments.maf > myAlignments.seg |
キーワード | アラインメント|セグメント |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 0.1|http://cbrc3.cbrc.jp/~martin/seg-suite/seg-suite-11.zip からソフトウェアをダウンロード |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | DNA-配列 , RNA-配列 |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | GPLv3 |
データ更新頻度 (過去2年間) | 1 |
最終更新日(調査日) | 2014/01/14 (2019/06/03) |
利用できるID | N/A |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | N/A |
論文等(PubMed ID) | なし |
稼働状況 | 公開中 |