成果物名 seg-suite
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

"配列セグメントの交差や配列アラインメントの合成を行うツールです。このツールでは「seg」フォーマットを利用できます。また、様々なデータフォーマットを「seg」フォーマットに変換する事ができます。"

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://cbrc3.cbrc.jp/~martin/seg-suite/
インターフェイス CUI
入力

出力

入力例

さまざまなデータフォーマットから、セグメントやアラインメントを作成する例:seg-import maf myAlignments.maf > myAlignments.seg

キーワード
アラインメント|セグメント
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 0.1|http://cbrc3.cbrc.jp/~martin/seg-suite/seg-suite-11.zip からソフトウェアをダウンロード
使っている外部リソース なし
主な対象データ "DNA-配列 , RNA-配列"
生物種
全生物種
利用条件 GPLv3
データ更新頻度 (過去2年間) 1
最終更新日(調査日) 2014/01/14 (2014/01/30)
利用できるID
N/A
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

N/A

論文等(PubMed ID)

なし