成果物名 DAFS
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

"期待精度最大化原理に基づいてRNA構造アラインメントを整数計画問題として定式化し,双対分解によってこれを高速に解くRNA配列アラインメントツールです。DAFSはFASTAフォーマットを入力として、構造アラインメントを出力します。"

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL 運用終了
インターフェイス CUI
入力

出力

入力例

FASTAフォーマットのファイルからアラインメントを作成するコマンドの例:> dafs RF00005:0.fa

キーワード
期待精度最大化|双対分解
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 なし
使っている外部リソース なし
主な対象データ RNA
生物種
全生物種
利用条件 GPLv.3
データ更新頻度 (過去2年間) 0
最終更新日(調査日) 2013/03/22 (2014/01/30)
利用できるID
N/A
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

N/A

論文等(PubMed ID)

pmid:23060618