DAFS
| 成果物名 | DAFS |
|---|---|
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | 期待精度最大化原理に基づいてRNA構造アラインメントを整数計画問題として定式化し,双対分解によってこれを高速に解くRNA配列アラインメントツールです。DAFSはFASTAフォーマットを入力として、構造アラインメントを出力します。 |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | - |
| インターフェイス | CUI |
| 入力 | |
| 出力 | |
| 入力例 | FASTAフォーマットのファイルからアラインメントを作成するコマンドの例：> dafs RF00005:0.fa |
| キーワード | 期待精度最大化|双対分解 |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | なし |
| 使っている外部リソース | なし |
| 主な対象データ | RNA |
| 生物種 | 全生物種 |
| 利用条件 | GPLv.3 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 0 |
| 最終更新日（調査日） | 2013/03/22 (2019/06/03) |
| 利用できるID | N/A |
| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
| 外部リンク | N/A |
| 論文等（PubMed ID） | pmid:23060618 |
| 稼働状況 | 運用終了 |