成果物名 | SAHG |
成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | ヒトゲノム予測構造・機能アノテーションの包括的なデータベースです。タンパク質をコードする全ORFが構造予測の対象です。このデータベースの開発ではJST(独立行政法人 科学技術振興機構)のサポートを受けています(出典:オリジナルサイト)。 |
成果物のタイプ | DB |
運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/sahg/desc.html |
インターフェイス | GUI |
入力例 | トップページにある染色体図をクリック後に、タンパク質ドメインイメージ図をクリックする。 |
キーワード | 構造|ヒト|タンパク質|予測|blast|psi-blast|PPSW|P3A|FORTE|MODELLER |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 0|なし |
使っている外部リソース | RefSeq|PDB|SCOP|HPRD|EzCatDB|KEGG |
主な対象データ | タンパク質-立体構造 |
生物種 | ヒト |
利用条件 | http://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/sahg/lic.html |
データ更新頻度 (過去2年間) | 0 |
最終更新日(調査日) | 2010/06/25 (2019/07/02) |
利用できるID | RefSeq_ID |
IDを使った成果物の利用方法 | http://bird.cbrc.jp/sahg/cgi-bin/detail.cgi?rid=[RefSeq_ID]&domain=0 |
外部リンク | RefSeq(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/)|PDB(http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do)|SCOP(http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/)|HPRD(http://www.hprd.org/index_html)|EzCatDB(http://mbs.cbrc.jp/EzCatDB/)|KEGG(http://www.genome.jp/kegg/kegg2.html)|Swiss-Prot(http://www.uniprot.org/)|InterPro(http://www.ebi.ac.uk/interpro/) |
論文等(PubMed ID) | pmid:21051360 |
稼働状況 | 稼働中 |