成果物名 MDV
成果物の別名 Motif Distribution Viewer
成果物に関する説明

Motif Distribution Viewer (MDV)は、プロモーター・モチーフの転写開始点(TSS)付近の位置分布を表示するツールです。プロモーター群をユーザーが指定できます(オリジナルサイトからの訳)。ツールはオリジナルサイトでも利用できますし、ダウンロードしてローカルマシンで利用することもできます。

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
機関所在国 日本
サイトURL 運用終了
インターフェイス GUI
入力

出力

入力例

Step 1:遺伝子のセットを選択する。Step 2:パラメーターをセットする。Step 3:モチーフビューを選択し、4つのSubmitボタンのうち、該当するモチーフビューのボタンをクリックする。

キーワード
cis-element|promoter|transcription start site (TSS)|2次元表示|マルチプルモチーフ|マイクロアレイ
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 207|http://h-invitational.jp/mdv/doc/download.html
使っている外部リソース H-InvDB | RefSeq | DBTSS | JASPAR
主な対象データ DNA-モチーフ
生物種
ヒト、マウスがサイト上で利用可能
利用条件 表示-継承
データ更新頻度 (過去2年間) 0
最終更新日(調査日) 2009/09/20 (2012/07/26)
利用できるID
H-Inv cluster ID (HIX) | RefSeq ID
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

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論文等(PubMed ID)

なし