ツール

MDV

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成果物名MDV
成果物の別名Motif Distribution Viewer
成果物に関する説明Motif Distribution Viewer (MDV)は、プロモーター・モチーフの転写開始点(TSS)付近の位置分布を表示するツールです。プロモーター群をユーザーが指定できます(オリジナルサイトからの訳)。ツールはオリジナルサイトでも利用できますし、ダウンロードしてローカルマシンで利用することもできます。
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
機関所在国日本
サイトURL-
インターフェイスGUI
入力
出力
入力例Step 1:遺伝子のセットを選択する。Step 2:パラメーターをセットする。Step 3:モチーフビューを選択し、4つのSubmitボタンのうち、該当するモチーフビューのボタンをクリックする。
キーワードcis-element|promoter|transcription start site (TSS)|2次元表示|マルチプルモチーフ|マイクロアレイ
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法207|http://h-invitational.jp/mdv/doc/download.html
使っている外部リソースH-InvDB | RefSeq | DBTSS | JASPAR
主な対象データDNA-モチーフ
生物種ヒト、マウスがサイト上で利用可能
利用条件表示-継承
データ更新頻度 (過去2年間)0
最終更新日(調査日)2009/09/20 (2019/06/03)
利用できるIDH-Inv cluster ID (HIX) | RefSeq ID
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンク-
論文等(PubMed ID)なし
稼働状況運用終了