成果物名 | MDV |
成果物の別名 | Motif Distribution Viewer |
成果物に関する説明 | Motif Distribution Viewer (MDV)は、プロモーター・モチーフの転写開始点(TSS)付近の位置分布を表示するツールです。プロモーター群をユーザーが指定できます(オリジナルサイトからの訳)。ツールはオリジナルサイトでも利用できますし、ダウンロードしてローカルマシンで利用することもできます。 |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | - |
インターフェイス | GUI |
入力 | |
出力 | |
入力例 | Step 1:遺伝子のセットを選択する。Step 2:パラメーターをセットする。Step 3:モチーフビューを選択し、4つのSubmitボタンのうち、該当するモチーフビューのボタンをクリックする。 |
キーワード | cis-element|promoter|transcription start site (TSS)|2次元表示|マルチプルモチーフ|マイクロアレイ |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 207|http://h-invitational.jp/mdv/doc/download.html |
使っている外部リソース | H-InvDB | RefSeq | DBTSS | JASPAR |
主な対象データ | DNA-モチーフ |
生物種 | ヒト、マウスがサイト上で利用可能 |
利用条件 | 表示-継承 |
データ更新頻度 (過去2年間) | 0 |
最終更新日(調査日) | 2009/09/20 (2019/06/03) |
利用できるID | H-Inv cluster ID (HIX) | RefSeq ID |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | - |
論文等(PubMed ID) | なし |
稼働状況 | 運用終了 |