ツール

PubMedScan

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成果物名PubMedScan
成果物の別名なし
成果物に関する説明新規関連文献お知らせツールPubMedScanは、NCBI PubMedの医学生物学の学術文献中から、興味のあるトピックスで新規にPubMedに登録された文献を定期的に(毎日)メールでお知らせするツールです。特徴は、1)サーチ条件は通常のキーワード入力ではなく、手持ちの文献(PubMed ID)リストで行います。2)新規文献から関連するものを定期的にメールでレポートします。3)文献関連指標には、PubMed が提供するRelated Articleの機能を利用しています。4)Web版(ver. 2.0)と、Linuxにインストールするローカル版(ver 1.1)があります。ローカル版では、UNIX(Linux/Macintosh)上での PHP、 MySQL、Apache、および各種Perlモジュールが必要です。キーワード検索では漏れてしまう文献や、頻繁に見ないジャーナルの文献を拾えるので、調査漏れを防ぐのに非常に有効です。PubMedScanの条件入力を助けるため、手持ちの複数の論文(PDFファイル)から、簡単にそれらのPubMed IDリストを得るソフト(PMID-Extractor)を提供しています。
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttps://medals.jp/pubmedscan/
インターフェイスGUI
入力
出力
入力例ユーザー名、Emailアドレスを登録。「Addition of articles」画面のボックスに興味のある文献(PubMed IDリスト)を入れて、「Register」を押して登録する。登録した文献を「Preferred articles」画面で確認する。昼12時ころに、関連文献の情報が毎日メールで送付される。 「Preferred articles」画面で、文献にチェックマークをつけてRecommendを押すと、昨日分について検索した結果がメールされる。
キーワードリコメンデーション | コンテンツベースフィルタリング
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法"[Web版]無し[ローカル版]プログラム一式 (gz)マニュアル (PDF・英語)"
使っている外部リソースPURE(ローカル版のみ) | PubMedのWebサービスeUtils(ローカル版、Web版)
主な対象データPubMedに登録されている文献
生物種なし
利用条件GPL(ローカル版)
データ更新頻度 (過去2年間)2
最終更新日(調査日)2018/06/17(2019/06/03)
利用できるIDPubMed ID
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクPubMed (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/)
論文等(PubMed ID)なし
稼働状況公開中