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CentroidFold
| 成果物名 | CentroidFold |
|---|---|
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | CentroidFoldはRNAの２次構造予測および共通２次構造予測を行うためのソフトウェアです。ベンチマークテストではMfoldやRNAfoldよりも優れた予測性能を発揮することが確かめられています。 |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://rtools.cbrc.jp/ |
| インターフェイス | GUI |
| 入力 | 塩基配列(FASTAフォーマット) |
| 出力 | RNAの2次構造（テキスト, PNG, PDF, EPSフォーマット） |
| 入力例 | RNA配列を入力すると２次構造予測結果を表示する。RNA配列群を入力すると共通２次構造予測結果を表示する。 |
| キーワード | RNA | 共通2次構造 | 予測 |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | なし |
| 使っている外部リソース | なし |
| 主な対象データ | RNA |
| 生物種 | 全生物種 |
| 利用条件 | 表示-継承 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 1 |
| 最終更新日（調査日） | 2018/07/05（2019/06/03） |
| 利用できるID | - |
| IDを使った成果物の利用方法 | 適用なし |
| 外部リンク | - |
| 論文等（PubMed ID） | pmid:19095700 | pmid:19435882 |
| 稼働状況 | 公開中 |
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