成果物名 CentroidFold
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

CentroidFoldはRNAの2次構造予測および共通2次構造予測を行うためのソフトウェアです。ベンチマークテストではMfoldやRNAfoldよりも優れた予測性能を発揮することが確かめられています。

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://rtools.cbrc.jp/
インターフェイス GUI
入力

塩基配列(FASTAフォーマット)

出力

"RNAの2次構造(テキスト, PNG, PDF, EPSフォーマット)"

入力例

RNA配列を入力すると2次構造予測結果を表示する。RNA配列群を入力すると共通2次構造予測結果を表示する。

キーワード
RNA | 共通2次構造 | 予測
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 なし
使っている外部リソース なし
主な対象データ RNA
生物種
全生物種
利用条件 表示-継承
データ更新頻度 (過去2年間) 1
最終更新日(調査日) 2014/01/09 (2014/01/10)
利用できるID
-
IDを使った成果物の利用方法 適用なし
外部リンク

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論文等(PubMed ID)

pmid:19095700 | pmid:19435882