成果物名 | FORTE |
成果物の別名 | なし |
成果物に関する説明 | FORTEは、タンパク質構造類似性検索のためのプロファイル-プロファイル比較ツールです。ユーザーは、問い合わせタンパク質のアミノ酸配列を用いて、既知立体構造との類似性検索を行うことが可能です。検索結果は、ペアワイズアラインメントの形式で表示されます。 |
成果物のタイプ | Tool |
運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | http://forteprtl.cbrc.jp/forte/ |
インターフェイス | GUI |
入力 | アミノ酸配列(FASTAフォーマット) |
出力 | 鋳型構造(テキスト(TSV)) |
入力例 | サイト画面において、FASTAフォーマットのアミノ酸配列をアップロード(もしくはペースト)し、submitボタンをクリックする。 |
キーワード | タンパク質 | 立体構造 | ペアワイズアラインメント | アミノ酸配列 |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 0.0|なし |
使っている外部リソース | NCBI | ASTRAL |
主な対象データ | タンパク質-立体構造 |
生物種 | 全生物種 |
利用条件 | アカデミックおよび非営利ユーザーは無料。商業利用の場合ライセンス契約が必要 |
データ更新頻度 (過去2年間) | 147 |
最終更新日(調査日) | 2014/03/26 (2019/06/03) |
利用できるID | なし |
IDを使った成果物の利用方法 | 適用外 |
外部リンク | なし |
論文等(PubMed ID) | pmid:14764565 | pmid:16187352 |
稼働状況 | 公開中 |