成果物名 FORTE
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

FORTEは、タンパク質構造類似性検索のためのプロファイル-プロファイル比較ツールです。ユーザーは、問い合わせタンパク質のアミノ酸配列を用いて、既知立体構造との類似性検索を行うことが可能です。検索結果は、ペアワイズアラインメントの形式で表示されます。

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://forteprtl.cbrc.jp/forte/
インターフェイス GUI
入力

アミノ酸配列(FASTAフォーマット)

出力

鋳型構造(テキスト(TSV))

入力例

サイト画面において、FASTAフォーマットのアミノ酸配列をアップロード(もしくはペースト)し、submitボタンをクリックする。

キーワード
タンパク質 | 立体構造 | ペアワイズアラインメント | アミノ酸配列
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 0.0|なし
使っている外部リソース NCBI | ASTRAL
主な対象データ タンパク質-立体構造
生物種
全生物種
利用条件 アカデミックおよび非営利ユーザーは無料。商業利用の場合ライセンス契約が必要
データ更新頻度 (過去2年間) 147
最終更新日(調査日) 2014/03/26 (2014/03/27)
利用できるID
なし
IDを使った成果物の利用方法 適用外
外部リンク

なし

論文等(PubMed ID)

pmid:14764565 | pmid:16187352