ツール

FORTE

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成果物名FORTE
成果物の別名なし
成果物に関する説明FORTEは、タンパク質構造類似性検索のためのプロファイル-プロファイル比較ツールです。ユーザーは、問い合わせタンパク質のアミノ酸配列を用いて、既知立体構造との類似性検索を行うことが可能です。検索結果は、ペアワイズアラインメントの形式で表示されます。
成果物のタイプTool
運用機関産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://forteprtl.cbrc.jp/forte/
インターフェイスGUI
入力アミノ酸配列(FASTAフォーマット)
出力鋳型構造(テキスト(TSV))
入力例サイト画面において、FASTAフォーマットのアミノ酸配列をアップロード(もしくはペースト)し、submitボタンをクリックする。
キーワードタンパク質 | 立体構造 | ペアワイズアラインメント | アミノ酸配列
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法0.0|なし
使っている外部リソースNCBI | ASTRAL
主な対象データタンパク質-立体構造
生物種全生物種
利用条件アカデミックおよび非営利ユーザーは無料。商業利用の場合ライセンス契約が必要
データ更新頻度 (過去2年間)147
最終更新日(調査日)2014/03/26 (2019/06/03)
利用できるIDなし
IDを使った成果物の利用方法適用外
外部リンクなし
論文等(PubMed ID)pmid:14764565 | pmid:16187352
稼働状況公開中