成果物名 アカシアESTデータベース
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

実用植物であるアカシア(Acacia mangium)のESTを6253個、配列決定し、そのデータを蓄積したデータベース。配列相同性による検索ができる。

成果物のタイプ DB
運用機関 京都大学
機関所在国 日本
サイトURL http://www.rish.kyoto-u.ac.jp/W/LMSFPM/home/blast/blast_search.htm
インターフェイス GUI
入力例

テキストボックス”Query Sequence”にサンプル配列を入力して[submit query]ボタンを押す。>sample_seqgatcaactcgagatgttagaaggtgcaaaactaataggggccggagctgctacaattgctcagcgggagctgctatcggtattggaaacgtccttagttcctcgattcattccgtggct

キーワード
アカシア| EST | データベース
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 0|なし
使っている外部リソース なし
主な対象データ DNA-配列 EST
生物種
"Acacia mangium [Taxonomy_id: 224085, アカシア]"
利用条件 なし
データ更新頻度 (過去2年間) 1回/1年
最終更新日(調査日) 2010/07/00 (2010/08/02)
利用できるID
調査中
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

調査中

論文等(PubMed ID)

Shiro Suzuki, Kunihiro Suda, Nozomu Sakurai, Yoshiyuki Ogata, Takefumi Hattori, Hideyuki Suzuki, Daisuke Shibata, Toshiaki Umezawa (2010) Analysis of expressed sequence tags in developing secondary xylem and shoot of Acacia mangium. Journal of Wood Science.