| 成果物名 | PPI view |
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| 成果物の別名 | Protein-Protein Interaction viewer |
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| 成果物に関する説明 | PPI viewは、ヒトのタンパク質間相互作用 (PPI:Protein-Protein Interaction)情報を表示しています。主要な５つのPPIデータベース(BIND, DIP, MINT, HPRD, IntAct)から、データの収集・統合を行い、H-InvDBの独自予測されたタンパク質についてPPIの割り当てを行いました。その結果、9,268件のタンパク質からなる32,198件のヒトのタンパク質間相互作用情報が得られました。 (H-InvDB version 5.0時点)PPI viewはユーザーの興味あるタンパク質(遺伝子産物)と相互作用するタンパク質を表示し、そのタンパク質の遺伝子の位置(Locus view)や遺伝子の機能情報(cDNA view)へのリンク、そしてデータ元PPIデータベースへの参照情報や、文献、実験手法を表示します。PPI view: http://www.h-invitational.jp/hinv/ppi/ PPI view サンプル画面:http://www.h-invitational.jp/hinv/ppi/ppi_view.cgi?hip=HIP000084307 |
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| 成果物のタイプ | DB |
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| 運用機関 | 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター |
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| 機関所在国 | 日本 |
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| サイトURL | http://www.h-invitational.jp/hinv/ppi/index.html |
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| インターフェイス | GUI |
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| 入力例 | TOPページ(http://www.h-invitational.jp/hinv/ppi/index.html)にある検索窓に興味のあるタンパク質に関するキーワードを入力することで検索を行うことができます。H-InvDBの各種IDやAccessionも同様にクエリーとして用いることができます。 |
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| キーワード | PPI | タンパク質間相互作用 | protein-protein interaction |
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| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 0.0|なし |
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| 使っている外部リソース | BIND http://www.bind.ca/Action|DIP http://dip.doe-mbi.ucla.edu|MINT http://mint.bio.uniroma2.it/mint/Welcome.do|HPRD http://www.hprd.org|IntAct http://www.ebi.ac.uk/intact/index.jsp|GNP_Y2H http://genomenetwork.nig.ac.jp/public/sys/gnppub/Top.do |
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| 主な対象データ | タンパク質-プロテオーム |
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| 生物種 | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] |
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| 利用条件 | 利用自由 |
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| データ更新頻度 (過去2年間) | 1 |
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| 最終更新日（調査日） | 2015/04/02 (2019/07/04) |
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| 利用できるID | H-Inv cluster ID (HIX) | H-Inv transcript ID (HIT) | H-Inv protein ID (HIP) |
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| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
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| 外部リンク | なし |
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| 論文等（PubMed ID） | なし |
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| 稼働状況 | 稼働中 |
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