データベース

VarySysDB

noimage
成果物名VarySysDB
成果物の別名なし
成果物に関する説明VarySysDBは、ゲノム統合プロジェクトによって、H-Inv転写産物に関連付けられる形で注釈付けられたヒト多型情報を、公開する目的で作成されたデータベースです。つまり、転写領域やスプライス・サイト上の一塩基多型、挿入欠失多型、STR多型、単一アミノ酸多型、構造多型、連鎖不平衡領域について、それぞれH-InvDBの転写産物と機能ドメインに関連づけて、情報整備して公開しています。VarySysDBでは、個々の多型情報ごと及び転写産物ごとに整備された情報を、検索し表示ができる他、キーワードによる検索も可能になりました。検索した情報はダウンロードもできます。
成果物のタイプDB
運用機関産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
機関所在国日本
サイトURLhttp://h-invitational.jp/varygene/home.htm
インターフェイス検索サイト
入力例トップ画面右上の入力フォームにHIX等を記入してGOボタンを押してください。
キーワード転写産物
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法-|なし
使っている外部リソースH-InvDB | dbSNP
主な対象データDNA-多型
生物種Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
利用条件表示-継承
データ更新頻度 (過去2年間)1
最終更新日(調査日)2015/04/02 (2019/07/04)
利用できるIDH-Inv cluster ID (HIX) | HUGO gene symbol
IDを使った成果物の利用方法なし
外部リンクなし
論文等(PubMed ID)なし
稼働状況稼働中