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Evola
| 成果物名 | Evola |
|---|---|
| 成果物の別名 | Evola: Evolutionary annotation database |
| 成果物に関する説明 | Evola (Evolutionary annotation database)はH-InvDBのサブデータベースの1つとして、ヒト遺伝子の分子進化アノテーション情報を格納しています。ヒトと14のモデル生物とのオーソログについて、アラインメントや系統樹、正負の自然選択情報を提供しています。オーソログ解析対象の生物はヒト、チンパンジー、オランウータン、マカクザル、マウス、ラット、イヌ、ウマ、ウシ、オポッサム、ニワトリ、ゼブラフィッシュ、メダカ、ミドリフグ、トラフグです。 |
| 成果物のタイプ | DB |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://www.h-invitational.jp/evola/search_jp.html |
| インターフェイス | GUI |
| 入力例 | トップ／サーチページ上部の"Evola Search ortholog by"で、プルダウンメニューから"Keyword (Human)"を選び、テキストボックスに"calmodulin"を入力して"submit"ボタンを押す。 |
| キーワード | オルソログ | パラログ | 比較ゲノム | 脊椎動物 |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 223.8|http://www.h-invitational.jp/evola/download_jp.html |
| 使っている外部リソース | H-InvDB | DDBJ | Ensembl | RefSeq | UCSC | GO | InterPro | HGNC |
| 主な対象データ | 比較ゲノム |
| 生物種 | Homo sapiens | Pan troglodytes | Pongo abelii | Bos taurus [Taxonomy_id: 9913, ウシ] | Canis familiaris [Taxonomy_id: 9615, イヌ] | Danio rerio [Taxonomy_id: 7955, ゼブラフィッシュ] | Equus caballus [Taxonomy_id: 9796, ウマ] | Gallus gallus [Taxonomy_id: 9031, ニワトリ] | Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト] | Macaca mulatta [Taxonomy_id: 9544, アカゲザル] | Monodelphis domestica [Taxonomy_id: 13616, ハイイロジネズミオポッサム] | Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス] | Oryzias latipes [Taxonomy_id: 8090, メダカ] | Pan troglodytes [Taxonomy_id: 9598, チンパンジー] | Pongo abelii [Taxonomy_id: 9601, スマトラオランウータン] | Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット] | Takifugu rubripes [Taxonomy_id: 31033, トラフグ] | Tetraodon nigroviridis [Taxonomy_id: 99883] |
| 利用条件 | 表示-継承 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 8 |
| 最終更新日（調査日） | 2010/12/03 (2019/07/04) |
| 利用できるID | H-Inv transcript ID (HIT) | Accession Number | HUGO gene symbol |
| IDを使った成果物の利用方法 | http://h-invitational.jp/hinv/evola/annotation?AccessionNum=[HIT] |
| 外部リンク | H-InvDB | DDBJ | Ensembl | RefSeq | UCSC | GO | InterPro | HGNC |
| 論文等（PubMed ID） | pmid:17982176 |
| 稼働状況 | 稼働中 |
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