成果物名 Evola
成果物の別名 Evola: Evolutionary annotation database
成果物に関する説明

Evola (Evolutionary annotation database)はH-InvDBのサブデータベースの1つとして、ヒト遺伝子の分子進化アノテーション情報を格納しています。ヒトと14のモデル生物とのオーソログについて、アラインメントや系統樹、正負の自然選択情報を提供しています。オーソログ解析対象の生物はヒト、チンパンジー、オランウータン、マカクザル、マウス、ラット、イヌ、ウマ、ウシ、オポッサム、ニワトリ、ゼブラフィッシュ、メダカ、ミドリフグ、トラフグです。

成果物のタイプ DB
運用機関 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://www.h-invitational.jp/evola/search_jp.html
インターフェイス GUI
入力例

トップ/サーチページ上部の"Evola Search ortholog by"で、プルダウンメニューから"Keyword (Human)"を選び、テキストボックスに"calmodulin"を入力して"submit"ボタンを押す。

キーワード
オルソログ | パラログ | 比較ゲノム | 脊椎動物
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 223.8|http://www.h-invitational.jp/evola/download_jp.html
使っている外部リソース H-InvDB | DDBJ | Ensembl | RefSeq | UCSC | GO | InterPro | HGNC
主な対象データ 比較ゲノム
生物種
"Homo sapiens | Pan troglodytes | Pongo abelii | ... More
  • Bos taurus [Taxonomy_id: 9913, ウシ]
  • Canis familiaris [Taxonomy_id: 9615, イヌ]
  • Danio rerio [Taxonomy_id: 7955, ゼブラフィッシュ]
  • Equus caballus [Taxonomy_id: 9796, ウマ]
  • Gallus gallus [Taxonomy_id: 9031, ニワトリ]
  • Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
  • Macaca mulatta [Taxonomy_id: 9544, アカゲザル]
  • Monodelphis domestica [Taxonomy_id: 13616, ハイイロジネズミオポッサム]
  • Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス]
  • Oryzias latipes [Taxonomy_id: 8090, メダカ]
  • Pan troglodytes [Taxonomy_id: 9598, チンパンジー]
  • Pongo abelii [Taxonomy_id: 9601, スマトラオランウータン]
  • Rattus norvegicus [Taxonomy_id: 10116, ラット]
  • Takifugu rubripes [Taxonomy_id: 31033, トラフグ]
  • Tetraodon nigroviridis [Taxonomy_id: 99883]
"
利用条件 表示-継承
データ更新頻度 (過去2年間) 8
最終更新日(調査日) 2010/12/03 (2010/12/06)
利用できるID
H-Inv transcript ID (HIT) | Accession Number | HUGO gene symbol
IDを使った成果物の利用方法 http://h-invitational.jp/hinv/evola/annotation?AccessionNum=[HIT]
外部リンク

H-InvDB | DDBJ | Ensembl | RefSeq | UCSC | GO | InterPro | HGNC

論文等(PubMed ID)

pmid:17982176