成果物名 JSNP DATABASE
成果物の別名 JSNP
成果物に関する説明

日本人一般集団786人を対象に遺伝子型の決定を行い、アレル(対立遺伝子)頻度のデータを第9回公開から提供しています。NEDOプロジェクトの成果(データ)が一部含まれています。

成果物のタイプ DB
運用機関 東京大学 | 科学技術振興機構
機関所在国 日本
サイトURL http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/index.html
インターフェイス GUI
入力例

サイトURL画面上部検索テキストボックスに”BRCA1”を入力して、[検索]ボタンを押す。

キーワード
SNPs
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 14.1|http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/data_download_ja.htmlからファイルダウンロード
使っている外部リソース NCBI | Ensembl | dbSNP
主な対象データ DNA-多型 アレル(対立遺伝子)頻度
生物種
"Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]"
利用条件 Genotype頻度データのダウンロードにはアカウントが必要。
データ更新頻度 (過去2年間) 2
最終更新日(調査日) 2013/03/27 (2013/03/28)
利用できるID
JSNP ID
IDを使った成果物の利用方法 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/SnpInfo.cgi?SNP_ID=[JSNP ID]
外部リンク

N/A

論文等(PubMed ID)

pmid:12436197 | pmid:11752280 | pmid:12426569