成果物名 EzCatDB
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

"EzCatDBデータベースでは、酵素立体構造情報、文献情報などに基いて、酵素触媒機構を階層的に分類しています。各酵素エントリーには、酵素番号(EC number)、PDBエントリー、触媒部位、リガンド情報や文献情報、触媒機構に関する情報、他のデータベース(Swiss-prot, CATH, KEGG, PDBsum, PubMed, CSA & MACiE)へのリンクがはられています。 "

成果物のタイプ DB
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://ezcatdb.cbrc.jp/EzCatDB/
インターフェイス GUI
入力例

Search Pageで、"Enzyme Name in KEGG"ボックスに酵素名("amylase"など)を入力し、画面下の[Search]ボタンを押す

キーワード
酵素
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 0|今のところサービスしていません。
使っている外部リソース SWISS-Prot | PDB | PubMed | KEGG | CATH | PDBsum | CSA | MACiE | 文献
主な対象データ タンパク質-立体構造 酵素
生物種
全生物種
利用条件 表示-非営利-継承ユーザーアカウント不要
データ更新頻度 (過去2年間) 12
最終更新日(調査日) 2013/11/14 (2013/11/15)
利用できるID
DB code (酵素ID) | EC number | PDB ID | CATH code | KEGG Pathway ID | UniProt Accession Number | PubMed ID
IDを使った成果物の利用方法 http://mbs.cbrc.jp/EzCatDB/search/get.do?dbcode=[DB code]
外部リンク

SWISS-Prot | PDB | PubMed | KEGG | CATH | PDBsum | PDBj | CSA | MACiE

論文等(PubMed ID)

pmid:17039546 | pmid:15608227 | Nagano N., Nakagawa Z., Arita M., Tsukamoto K., Noguchi T. (2007) "EzCatDB" Nucleic Acids Research, Molecular Biology Database Collection entry number 613. | 長野希美 「酵素触媒機構データベース EzCatDB」 バイオテクノロジー ジャーナル (2006) Vol.6, No.4,(7|8月号 p.437-439 (羊土社) | 長野希美 「EzCatDB(酵素触媒機構データベースの開発)」 CBRC News Letter No.9, p.3 | 長野希美 「酵素触媒機構データベース:EzCatDB - 酵素触媒機構の理解から創薬へ」 AIST today (2005) vol.5, No.3, p.37