成果物名 ASTRA
成果物の別名 選択的スプライシング・選択的転写開始パターン分類データベース
成果物に関する説明

ASTRAは、ヒト、マウス、ハエ、線虫、シロイヌナズナ、イネに関する選択的スプライシング・選択的転写開始を自動検出し、パターンに従って分類したデータベースです。(オリジナルサイトから)

成果物のタイプ DB
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/astra/desc.html
インターフェイス GUI(JAVAアプレット)
入力例

サイト画面中央部検索ブルダウンメニューからSplicing Type”cassette”を選択して[Search!]ボタンをクリックします。

キーワード
選択的 | スプライシング | 転写開始パターン
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 -|なし
使っている外部リソース UniGene
主な対象データ DNA-配列
生物種
"Arabidopsis thaliana | Caenorhabditis elegans | Drosophila melanogaster | ... More
  • Arabidopsis thaliana [Taxonomy_id: 3702, シロイヌナズナ]
  • Caenorhabditis elegans [Taxonomy_id: 6239, 線虫]
  • Drosophila melanogaster [Taxonomy_id: 7227, キイロショウジョウバエ]
  • Homo sapiens [Taxonomy_id: 9606, ヒト]
  • Mus musculus [Taxonomy_id: 10090, マウス]
  • Oryza sativa [Taxonomy_id: 4530, イネ]
"
利用条件 http://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/astra/lic.html
データ更新頻度 (過去2年間) 0
最終更新日(調査日) 2005/01/01 (2009/01/21)
利用できるID
なし
IDを使った成果物の利用方法 なし
外部リンク

Human genome resources | UniGene | ensembl

論文等(PubMed ID)

pmid:16219431 | pmid:16500940