成果物名 | TOT-DB |
成果物の別名 | The Theileria orientalis Genome Annotation Database |
成果物に関する説明 | TOT-DB (The Theileria orientalis Genome Annotation Database)は、寄生性原虫タイレリア・オリエンタリスの遺伝子と転写産物を対象にしたデータベースです。G-integraプラットフォームのゲノムブラウザによって、発現データおよび遺伝子予測ソフトウェアからアノテーションされた遺伝子領域が表示されます。ゲノムブラウザ上で閲覧するだけではなく、BLASTによる相同検索やデータの一括ダウンロードも行えます。 |
成果物のタイプ | DB |
運用機関 | 北海道大学 人獣共通感染症リサーチセンター |
機関所在国 | 日本 |
サイトURL | - |
インターフェイス | GUI |
入力例 | メニュー[G-integra]からG-integraに移動し、"THEILERIA ORIENTALIS"の染色体をクリック |
キーワード | タイレリア・オリエンタリス | 寄生性原虫 |
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 12.02|http://totdb.czc.hokudai.ac.jp/download.html からファイルダウンロード |
使っている外部リソース | なし |
主な対象データ | 比較ゲノム |
生物種 | Theileria orientalis, Theileria parva, Theileria annulata |
利用条件 | 不明 |
データ更新頻度 (過去2年間) | 0 |
最終更新日(調査日) | 2013/07/29 (2019/07/02) |
利用できるID | TOT |
IDを使った成果物の利用方法 | なし |
外部リンク | なし |
論文等(PubMed ID) | pmid:22951932 |
稼働状況 | 運用終了 |