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Data and Biological Resource Platform(生物資源データプラットフォーム)

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成果物名Data and Biological Resource Platform(生物資源データプラットフォーム)
成果物の別名DBRP
成果物に関する説明生物資源に関する情報(コレクション情報や生物の特性情報、オミックス情報など)が利用できるデータプラットフォームです。NITE保有の微生物コレクションの他、DBRPへご登録いただいている外部機関のコレクションを検索することができます。また、DBRP Stanzaでは、理化学研究所JCM微生物リソースメタデータの微生物情報とNITEのコレクションを統合的に検索することができます。

NITE保有の微生物コレクションに関する情報は、今後様々な種類のデータを公開します。
例えば2021年11月現在、NITEのHPで提 しているMALDI-TOF MS微生物同定用ライブラリー(指紋判定法)
<https://www.nite.go.jp/nbrc/industry/maldi/maldi.html>の構築にあたって取得した微生物のMALDI-TOF MSデータなど、
産業界のニーズに合わせて公開していきます。
成果物のタイプDB
運用機関製品評価技術基盤機構
機関所在国日本
サイトURLhttps://www.nite.go.jp/nbrc/dbrp/top
インターフェイスGUI
入力例微生物の学名からの検索の他、「乳酸菌」といった一般的な言葉や、分離源、原産地などからも検索することができます。当該サイトの使い方は、YouTubeでも公開しています(https://www.youtube.com/watch?v=yaQd6mZ6WuE)。ご参照ください。
キーワード微生物株情報|微生物種情報|学名情報|微生物属性情報|文献情報|解析データ|実験情報|プロジェクト情報|コレクション情報|提供機関情報
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法約800GB | なし
使っている外部リソースなし
主な対象データ生物資源に関する情報(微生物株情報、分離源など)、データ(ゲノム、実験データ、画像など)
生物種微生物
利用条件利用規約参照(https://www.nite.go.jp/nbrc/dbrp/termsofuse)
データ更新頻度 (過去2年間)3か月に1回程度更新
最終更新日(調査日)2021/11/18
利用できるID先頭2文字 (微生物株情報:ST, 微生物種情報:SP, Taxonomy:TA, 属性情報:AT, 文献情報:DO, 解析情報:AN, 実験情報:EX, プロジェクト情報:PR,コレクション情報:CO, 提供機関情報:OR)からはじまる計13桁のデータID
IDを使った成果物の利用方法https://www.nite.go.jp/nbrc/dbrp/dataview?dataId=[データID]、またはAPIの利用
外部リンクなし
論文等(PubMed ID)なし
稼働状況稼働中